More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3493 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4212  succinate semialdehyde dehydrogenase  66.11 
 
 		 489 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0577  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.55 
 
 		 497 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289417  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3136  succinic semialdehyde dehydrogenase  86.75 
 
 		 483 aa  837    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0032  succinate semialdehyde dehydrogenase  69.81 
 
 		 498 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105667  normal  0.227937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0454  succinic semialdehyde dehydrogenase  67.37 
 
 		 497 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 483 aa  972    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0465  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.6 
 
 		 497 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0255  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.33 
 
 		 497 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  86.34 
 
 		 486 aa  842    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.83 
 
 		 482 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.03 
 
 		 482 aa  628  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  61.83 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.62 
 
 		 482 aa  627  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.83 
 
 		 482 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.83 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.19 
 
 		 483 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  61.83 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.62 
 
 		 482 aa  623  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.69 
 
 		 500 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.96 
 
 		 489 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  62.4 
 
 		 483 aa  622  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.15 
 
 		 483 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.78 
 
 		 483 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.94 
 
 		 489 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  63.94 
 
 		 489 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.73 
 
 		 489 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.94 
 
 		 489 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.94 
 
 		 489 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.94 
 
 		 489 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.12 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.12 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.15 
 
 		 484 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.71 
 
 		 482 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.83 
 
 		 484 aa  611  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.91 
 
 		 482 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6540  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.32 
 
 		 484 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  64.07 
 
 		 491 aa  610  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.41 
 
 		 480 aa  609  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.14 
 
 		 486 aa  611  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.88 
 
 		 493 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.13 
 
 		 479 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.88 
 
 		 489 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.51 
 
 		 482 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.08 
 
 		 482 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.29 
 
 		 480 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.54 
 
 		 479 aa  599  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.5 
 
 		 480 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.91 
 
 		 484 aa  601  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.25 
 
 		 486 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.09 
 
 		 486 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.5 
 
 		 482 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  61.34 
 
 		 480 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.83 
 
 		 489 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.08 
 
 		 482 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.34 
 
 		 489 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.32 
 
 		 486 aa  601  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.5 
 
 		 480 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.92 
 
 		 488 aa  601  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 		 482 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.04 
 
 		 489 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.08 
 
 		 482 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.08 
 
 		 480 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.73 
 
 		 485 aa  595  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  61.72 
 
 		 482 aa  596  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.13 
 
 		 479 aa  595  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0580  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.92 
 
 		 480 aa  595  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.83 
 
 		 489 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.83 
 
 		 489 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.5 
 
 		 482 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  60 
 
 		 484 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.54 
 
 		 492 aa  596  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.32 
 
 		 485 aa  595  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.83 
 
 		 489 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.25 
 
 		 484 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.36 
 
 		 488 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.31 
 
 		 483 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.73 
 
 		 509 aa  594  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.21 
 
 		 492 aa  591  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.09 
 
 		 483 aa  591  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.43 
 
 		 482 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 		 482 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.72 
 
 		 484 aa  594  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2003  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.3 
 
 		 496 aa  590  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000861925 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.75 
 
 		 483 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.75 
 
 		 480 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.96 
 
 		 480 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  60 
 
 		 493 aa  591  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.33 
 
 		 496 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.03 
 
 		 490 aa  588  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.8 
 
 		 482 aa  588  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.47 
 
 		 490 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.66 
 
 		 490 aa  587  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.17 
 
 		 486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.58 
 
 		 493 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1290  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.62 
 
 		 482 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3095  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.42 
 
 		 491 aa  578  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.06 
 
 		 479 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.54 
 
 		 500 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2637  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  61.55 
 
 		 480 aa  579  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.38 
 
 		 480 aa  578  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>