More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4676 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 491 aa  1004    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.28 
 
 		 493 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4025  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.89 
 
 		 493 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.577209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  57 
 
 		 492 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.83 
 
 		 489 aa  595  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8160  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  57.61 
 
 		 494 aa  596  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  58.88 
 
 		 482 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.88 
 
 		 482 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.88 
 
 		 482 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60 
 
 		 482 aa  592  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  58.88 
 
 		 482 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.47 
 
 		 492 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  60 
 
 		 482 aa  591  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.71 
 
 		 489 aa  588  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.57 
 
 		 496 aa  591  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.79 
 
 		 482 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60 
 
 		 482 aa  591  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  58.92 
 
 		 489 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 489 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 489 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.19 
 
 		 493 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 		 489 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 489 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 489 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 489 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.71 
 
 		 489 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.71 
 
 		 489 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.71 
 
 		 489 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.51 
 
 		 489 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.71 
 
 		 489 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.3 
 
 		 489 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.38 
 
 		 492 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.71 
 
 		 500 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 		 490 aa  578  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.71 
 
 		 480 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.92 
 
 		 480 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.79 
 
 		 483 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.02 
 
 		 480 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1012  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.17 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225997  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.39 
 
 		 486 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.56 
 
 		 488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.2 
 
 		 483 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 		 482 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.71 
 
 		 480 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  59.04 
 
 		 483 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.35 
 
 		 482 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 		 482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.8 
 
 		 482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.84 
 
 		 509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.8 
 
 		 482 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.94 
 
 		 482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.01 
 
 		 482 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.8 
 
 		 482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.58 
 
 		 483 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.35 
 
 		 480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.97 
 
 		 483 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.75 
 
 		 486 aa  568  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.99 
 
 		 484 aa  569  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.73 
 
 		 482 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.49 
 
 		 480 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.44 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.84 
 
 		 483 aa  571  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.85 
 
 		 492 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.6 
 
 		 479 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.49 
 
 		 480 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.39 
 
 		 479 aa  568  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.04 
 
 		 483 aa  568  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.85 
 
 		 482 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.41 
 
 		 486 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.79 
 
 		 493 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.65 
 
 		 480 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  55.9 
 
 		 482 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  58.4 
 
 		 491 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2887  NADP(+) dependentsuccinate-semialdehyde dehydrogenase  59.47 
 
 		 492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00129207  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.38 
 
 		 486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.77 
 
 		 484 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.05 
 
 		 485 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.24 
 
 		 488 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.23 
 
 		 485 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.98 
 
 		 492 aa  558  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.83 
 
 		 483 aa  558  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.97 
 
 		 484 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2257  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.05 
 
 		 490 aa  559  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.142739  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  57.05 
 
 		 480 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.04 
 
 		 479 aa  557  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.6 
 
 		 487 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.14 
 
 		 486 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.28 
 
 		 482 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2636  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 		 488 aa  552  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.28 
 
 		 482 aa  553  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.51 
 
 		 492 aa  552  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.85 
 
 		 484 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.99 
 
 		 486 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.67 
 
 		 488 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0580  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.68 
 
 		 480 aa  554  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.47 
 
 		 503 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.11 
 
 		 482 aa  554  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.06 
 
 		 482 aa  553  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.66 
 
 		 490 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.92 
 
 		 499 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.140672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>