More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2887 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.73 
 
 		 480 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  67.3 
 
 		 493 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  65.9 
 
 		 489 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2887  NADP(+) dependentsuccinate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 492 aa  999    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00129207  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  66.53 
 
 		 482 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.69 
 
 		 480 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.58 
 
 		 486 aa  641    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  65 
 
 		 483 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.9 
 
 		 489 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.32 
 
 		 480 aa  643    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.52 
 
 		 480 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.86 
 
 		 489 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.11 
 
 		 482 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.11 
 
 		 482 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.9 
 
 		 489 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.94 
 
 		 482 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.9 
 
 		 480 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1012  succinate semialdehyde dehydrogenase  76.83 
 
 		 511 aa  753    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.38 
 
 		 484 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.05 
 
 		 492 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.49 
 
 		 489 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.52 
 
 		 480 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.52 
 
 		 480 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  65.21 
 
 		 483 aa  640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.15 
 
 		 482 aa  653    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.39 
 
 		 488 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.35 
 
 		 482 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  63.28 
 
 		 482 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  70.73 
 
 		 490 aa  714    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8160  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  67.21 
 
 		 494 aa  659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2257  succinic semialdehyde dehydrogenase  76.63 
 
 		 490 aa  728    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.142739  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  76.42 
 
 		 492 aa  757    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  66.04 
 
 		 483 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.9 
 
 		 489 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.9 
 
 		 489 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  67.15 
 
 		 482 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  67.36 
 
 		 482 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  76.63 
 
 		 492 aa  751    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.15 
 
 		 482 aa  656    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.79 
 
 		 483 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.9 
 
 		 489 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  67.36 
 
 		 482 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  65 
 
 		 484 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.56 
 
 		 482 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.69 
 
 		 492 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.23 
 
 		 479 aa  632  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.69 
 
 		 482 aa  631  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.3 
 
 		 493 aa  631  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.86 
 
 		 489 aa  631  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.66 
 
 		 489 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.9 
 
 		 482 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.07 
 
 		 489 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  64.11 
 
 		 482 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.07 
 
 		 489 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.62 
 
 		 482 aa  633  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.66 
 
 		 489 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.69 
 
 		 482 aa  631  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.07 
 
 		 489 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  63.28 
 
 		 482 aa  628  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.49 
 
 		 482 aa  630  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  63.28 
 
 		 482 aa  628  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.28 
 
 		 482 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.88 
 
 		 509 aa  628  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.02 
 
 		 479 aa  629  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.07 
 
 		 482 aa  628  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  63.28 
 
 		 482 aa  628  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.69 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  65.42 
 
 		 500 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.23 
 
 		 488 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.12 
 
 		 486 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2637  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  66.8 
 
 		 480 aa  622  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.66 
 
 		 480 aa  618  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4025  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.43 
 
 		 493 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.577209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.96 
 
 		 493 aa  621  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  63.41 
 
 		 480 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.86 
 
 		 483 aa  614  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.8 
 
 		 496 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.01 
 
 		 489 aa  615  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.47 
 
 		 492 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.27 
 
 		 483 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.37 
 
 		 479 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.42 
 
 		 485 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.42 
 
 		 485 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.67 
 
 		 484 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.03 
 
 		 484 aa  608  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.06 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0134  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.51 
 
 		 495 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0428  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.04 
 
 		 486 aa  607  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.08 
 
 		 483 aa  605  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.86 
 
 		 499 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.86 
 
 		 499 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.85 
 
 		 483 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6245  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.77 
 
 		 490 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.584192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  66.6 
 
 		 486 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.81 
 
 		 486 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.53 
 
 		 500 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 		 486 aa  599  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.6 
 
 		 502 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.73 
 
 		 500 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.33 
 
 		 486 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>