More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4451 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
493 aa  1006    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  67.36 
 
 
495 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  71.58 
 
 
492 aa  711    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  65.9 
 
 
491 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  65.14 
 
 
487 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.62 
 
 
486 aa  588  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.87 
 
 
487 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  58.72 
 
 
485 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.26 
 
 
482 aa  542  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
489 aa  535  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  57.78 
 
 
487 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  53.83 
 
 
481 aa  526  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  54.37 
 
 
490 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.96 
 
 
477 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  55.18 
 
 
487 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.81 
 
 
497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  52.94 
 
 
487 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.84 
 
 
485 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  53.52 
 
 
496 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.01 
 
 
484 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  52.73 
 
 
482 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.19 
 
 
489 aa  499  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  53.19 
 
 
491 aa  499  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.19 
 
 
459 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.09 
 
 
493 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.2 
 
 
500 aa  492  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.74 
 
 
480 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.32 
 
 
480 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.74 
 
 
480 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.74 
 
 
480 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.26 
 
 
500 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.53 
 
 
480 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.37 
 
 
493 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  54.33 
 
 
488 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.68 
 
 
483 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  52.72 
 
 
497 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
480 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.05 
 
 
482 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.84 
 
 
482 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.05 
 
 
483 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
500 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2112  Aldehyde Dehydrogenase  51.48 
 
 
486 aa  475  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00293848  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.05 
 
 
483 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  48.84 
 
 
482 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
482 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  48.84 
 
 
482 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
489 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
490 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.68 
 
 
480 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.22 
 
 
482 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.63 
 
 
482 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.43 
 
 
482 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
500 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.84 
 
 
482 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 
502 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.84 
 
 
482 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.63 
 
 
482 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.63 
 
 
482 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  52.97 
 
 
502 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  54.22 
 
 
476 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.84 
 
 
482 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.63 
 
 
482 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  51.89 
 
 
489 aa  474  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2257  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
490 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.142739  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.63 
 
 
486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
479 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.82 
 
 
492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
492 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  51.49 
 
 
487 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.74 
 
 
496 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
490 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2081  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
498 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
501 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.74 
 
 
479 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2346  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
495 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.259477  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
489 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.74 
 
 
479 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.37 
 
 
482 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.37 
 
 
485 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
483 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  53.73 
 
 
499 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1012  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
511 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225997  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
482 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
490 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.43 
 
 
482 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
482 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
485 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8160  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  48.02 
 
 
494 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.32 
 
 
489 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
492 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4076  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.5 
 
 
500 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.21 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.74 
 
 
482 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.63 
 
 
493 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.48 
 
 
486 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 
483 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
479 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>