More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4598 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  973    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  64.97 
 
 
487 aa  617  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  65.41 
 
 
487 aa  611  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  65.03 
 
 
485 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.03 
 
 
484 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.13 
 
 
493 aa  578  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.21 
 
 
489 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  64.12 
 
 
491 aa  576  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  60.55 
 
 
490 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.75 
 
 
487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  66.18 
 
 
488 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.88 
 
 
497 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  62.66 
 
 
482 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  60.59 
 
 
496 aa  551  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  62.66 
 
 
482 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  62.13 
 
 
502 aa  548  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  63.73 
 
 
499 aa  550  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  63.62 
 
 
476 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.84 
 
 
493 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.2 
 
 
489 aa  539  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.02 
 
 
500 aa  538  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1858  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  62.89 
 
 
485 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.51 
 
 
495 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  62.24 
 
 
482 aa  532  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  59.62 
 
 
487 aa  534  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  59.15 
 
 
487 aa  531  1e-150  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  56.38 
 
 
487 aa  532  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.39 
 
 
514 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.98 
 
 
486 aa  532  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05360  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.54 
 
 
495 aa  528  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0233509  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  57.38 
 
 
489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.45 
 
 
490 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.7 
 
 
492 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.67 
 
 
483 aa  505  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.91 
 
 
489 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4076  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.99 
 
 
500 aa  492  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  55.77 
 
 
491 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.25 
 
 
480 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.28 
 
 
482 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.28 
 
 
482 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.03 
 
 
480 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.71 
 
 
480 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.07 
 
 
482 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  51.07 
 
 
482 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.07 
 
 
482 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  51.07 
 
 
482 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.07 
 
 
482 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.28 
 
 
482 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.07 
 
 
482 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.07 
 
 
482 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.49 
 
 
482 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.07 
 
 
482 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.28 
 
 
482 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.61 
 
 
483 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.46 
 
 
483 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.25 
 
 
493 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.64 
 
 
480 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.75 
 
 
480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  49.78 
 
 
481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.75 
 
 
483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.54 
 
 
480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  51.39 
 
 
482 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.54 
 
 
480 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.32 
 
 
483 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
481 aa  465  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.54 
 
 
477 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
486 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.96 
 
 
486 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
484 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.3 
 
 
490 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.08 
 
 
502 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
483 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.5 
 
 
484 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.24 
 
 
500 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
503 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.7 
 
 
492 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.54 
 
 
480 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
500 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.28 
 
 
484 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
491 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.28 
 
 
499 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.82 
 
 
483 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
479 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.61 
 
 
483 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
503 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2081  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.38 
 
 
498 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.28 
 
 
499 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8160  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  48.3 
 
 
494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.38 
 
 
501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.83 
 
 
485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
482 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.07 
 
 
488 aa  449  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.34 
 
 
484 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
488 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>