More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3337 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
487 aa  965    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  69.6 
 
 
482 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  69.18 
 
 
482 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  68.91 
 
 
476 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  69.39 
 
 
482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.43 
 
 
487 aa  594  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1858  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  68.75 
 
 
485 aa  591  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.8 
 
 
484 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.47 
 
 
489 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  60.79 
 
 
496 aa  569  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  61.03 
 
 
487 aa  568  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  61.41 
 
 
485 aa  568  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  60.75 
 
 
490 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  60.46 
 
 
491 aa  558  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.85 
 
 
493 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.76 
 
 
489 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.96 
 
 
497 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.65 
 
 
487 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.44 
 
 
490 aa  538  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  61.93 
 
 
488 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  61.57 
 
 
499 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  60.25 
 
 
483 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.74 
 
 
514 aa  528  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  57.17 
 
 
489 aa  525  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  57.47 
 
 
502 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.62 
 
 
485 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05360  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.61 
 
 
495 aa  512  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0233509  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.28 
 
 
489 aa  512  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.04 
 
 
500 aa  514  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  54.66 
 
 
487 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.49 
 
 
493 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.12 
 
 
486 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  51.7 
 
 
487 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.34 
 
 
495 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  52.35 
 
 
492 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.54 
 
 
481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.8 
 
 
477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  50.75 
 
 
482 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4076  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.2 
 
 
500 aa  463  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  51.87 
 
 
491 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
482 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.15 
 
 
483 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  48.29 
 
 
482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.5 
 
 
482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.08 
 
 
482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.86 
 
 
480 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.29 
 
 
482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.29 
 
 
480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.93 
 
 
482 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  48.29 
 
 
482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.21 
 
 
483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.08 
 
 
482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.5 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.29 
 
 
482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.08 
 
 
482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.72 
 
 
483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.64 
 
 
503 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.29 
 
 
480 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
482 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.93 
 
 
482 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.86 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.65 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.92 
 
 
493 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
500 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.01 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.65 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.65 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.47 
 
 
486 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
500 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
486 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.55 
 
 
459 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.65 
 
 
480 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.65 
 
 
480 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.65 
 
 
480 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
499 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.44 
 
 
482 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
499 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.97 
 
 
482 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.5 
 
 
488 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.51 
 
 
487 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
484 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
489 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
481 aa  435  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.55 
 
 
489 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
489 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.4 
 
 
489 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
484 aa  435  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
489 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.35 
 
 
502 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
489 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  48.61 
 
 
489 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.19 
 
 
489 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.76 
 
 
496 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.08 
 
 
486 aa  435  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
500 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
493 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.57 
 
 
482 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2112  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 
486 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00293848  normal  0.162574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>