More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2112 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2112  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
486 aa  967    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00293848  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  52.88 
 
 
487 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
493 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  52.11 
 
 
487 aa  465  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.01 
 
 
495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.37 
 
 
487 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  52.02 
 
 
485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  47.33 
 
 
481 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  51.89 
 
 
491 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.74 
 
 
477 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.38 
 
 
486 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  51.37 
 
 
496 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  51.8 
 
 
492 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.37 
 
 
482 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.32 
 
 
482 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  50.32 
 
 
476 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.11 
 
 
482 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
487 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  50.84 
 
 
487 aa  427  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
489 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
489 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.1 
 
 
459 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1858  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  51.17 
 
 
485 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  50.11 
 
 
490 aa  425  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.53 
 
 
514 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 
489 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
490 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.74 
 
 
482 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  48 
 
 
497 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  49.89 
 
 
487 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  51.69 
 
 
499 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  50.21 
 
 
502 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.06 
 
 
500 aa  409  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05360  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
495 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0233509  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.34 
 
 
489 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  51.79 
 
 
488 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.89 
 
 
484 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.79 
 
 
485 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  47.54 
 
 
491 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  45.53 
 
 
482 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2652  aldehyde dehydrogenase  43.46 
 
 
500 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
483 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2189  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
480 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.06 
 
 
483 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0145  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.12 
 
 
480 aa  375  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514167  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.91 
 
 
490 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.91 
 
 
490 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3929  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.04 
 
 
489 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
493 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.85 
 
 
483 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.85 
 
 
483 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.85 
 
 
483 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.64 
 
 
483 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.22 
 
 
480 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.85 
 
 
483 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.85 
 
 
483 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.64 
 
 
483 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.11 
 
 
488 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.91 
 
 
482 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.64 
 
 
483 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  41.49 
 
 
482 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.13 
 
 
482 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.43 
 
 
483 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  41.49 
 
 
482 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.49 
 
 
482 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.7 
 
 
482 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.58 
 
 
480 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.6 
 
 
487 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
483 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.91 
 
 
482 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.19 
 
 
481 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1888  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.42 
 
 
485 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000160423  normal  0.0242248 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.49 
 
 
482 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
480 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.43 
 
 
500 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.67 
 
 
485 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.88 
 
 
496 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.58 
 
 
480 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.92 
 
 
500 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.19 
 
 
483 aa  364  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.44 
 
 
483 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3173  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.13 
 
 
485 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.43 
 
 
490 aa  363  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.01 
 
 
483 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.49 
 
 
482 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.49 
 
 
482 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
500 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
479 aa  363  5.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3863  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.56 
 
 
485 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
489 aa  363  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
486 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.25 
 
 
493 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.86 
 
 
483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.15 
 
 
480 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.52 
 
 
489 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
503 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.15 
 
 
480 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
489 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.52 
 
 
492 aa  361  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>