More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0145 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0145  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
480 aa  979    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514167  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2189  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  84.13 
 
 
480 aa  827    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1546  succinate-semialdehyde dehydrogenase, putative  51.16 
 
 
475 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1262  Aldehyde Dehydrogenase  51.16 
 
 
475 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.77 
 
 
493 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.21 
 
 
489 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
490 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
481 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.37 
 
 
489 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.88 
 
 
489 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
483 aa  478  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
489 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
489 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
489 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.37 
 
 
489 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
489 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2346  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.61 
 
 
495 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.259477  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.62 
 
 
485 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.79 
 
 
489 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2081  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.19 
 
 
498 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  51.57 
 
 
482 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.79 
 
 
489 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  52.03 
 
 
489 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.58 
 
 
489 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.41 
 
 
485 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.79 
 
 
489 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.74 
 
 
483 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  50.32 
 
 
483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  50.32 
 
 
483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
489 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  50.53 
 
 
483 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  50.32 
 
 
483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  50.32 
 
 
483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  50.53 
 
 
483 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  50.32 
 
 
483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.94 
 
 
492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.47 
 
 
480 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.63 
 
 
490 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  50.11 
 
 
483 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
480 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  50.11 
 
 
483 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.26 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.47 
 
 
480 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.59 
 
 
484 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.22 
 
 
488 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
483 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.47 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.18 
 
 
479 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.26 
 
 
480 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  51.27 
 
 
480 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.11 
 
 
483 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  49.48 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.69 
 
 
482 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  49.48 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.2 
 
 
480 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4025  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.34 
 
 
493 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.577209  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.06 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
490 aa  458  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.34 
 
 
479 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.71 
 
 
483 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1978  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.44 
 
 
496 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.27 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.48 
 
 
482 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2905  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.35 
 
 
494 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1778  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.55 
 
 
496 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.48 
 
 
482 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.48 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.34 
 
 
479 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  52.03 
 
 
491 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.17 
 
 
483 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.64 
 
 
482 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
486 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
483 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  50.21 
 
 
480 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.63 
 
 
483 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.06 
 
 
482 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2636  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
488 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.85 
 
 
482 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.97 
 
 
488 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.91 
 
 
501 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2534  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
486 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.85 
 
 
482 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 
485 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.63 
 
 
483 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
491 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.96 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1012  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 
511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225997  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.71 
 
 
483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.37 
 
 
488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.83 
 
 
486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
484 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
489 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.37 
 
 
492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.26 
 
 
488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>