More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1546 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1546  succinate-semialdehyde dehydrogenase, putative  100 
 
 
475 aa  961    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1262  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
475 aa  961    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0145  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
480 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514167  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2189  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.97 
 
 
480 aa  486  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.05 
 
 
483 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.8 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.8 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.8 
 
 
483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.37 
 
 
483 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.8 
 
 
483 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.8 
 
 
483 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.8 
 
 
483 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.8 
 
 
483 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.68 
 
 
481 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.8 
 
 
483 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
483 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.92 
 
 
482 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.92 
 
 
482 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.92 
 
 
482 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2905  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.97 
 
 
494 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  46.07 
 
 
482 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.28 
 
 
482 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.07 
 
 
482 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.71 
 
 
482 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  46.07 
 
 
482 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.07 
 
 
482 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.64 
 
 
479 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
482 aa  428  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2636  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.94 
 
 
488 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  45.86 
 
 
482 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.75 
 
 
493 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  45.86 
 
 
482 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.27 
 
 
493 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  45.34 
 
 
480 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.53 
 
 
482 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.59 
 
 
482 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.37 
 
 
482 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.59 
 
 
482 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  46.92 
 
 
482 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.01 
 
 
482 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.37 
 
 
482 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
479 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.86 
 
 
479 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.33 
 
 
484 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.95 
 
 
480 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.04 
 
 
483 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.75 
 
 
492 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.71 
 
 
480 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.92 
 
 
480 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.19 
 
 
490 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.67 
 
 
493 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.33 
 
 
483 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3732  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.5 
 
 
485 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253461  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.34 
 
 
490 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.71 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.5 
 
 
480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.17 
 
 
484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.07 
 
 
488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1533  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.17 
 
 
484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0666  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.02 
 
 
492 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.71 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
492 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.38 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.71 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.38 
 
 
486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.46 
 
 
491 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.78 
 
 
485 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  46.84 
 
 
491 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.36 
 
 
500 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.36 
 
 
500 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.76 
 
 
493 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
487 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
489 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.76 
 
 
486 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
486 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.74 
 
 
488 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3342  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.58 
 
 
492 aa  405  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.420157  normal  0.140471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.14 
 
 
482 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
503 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
503 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.62 
 
 
492 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.32 
 
 
484 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.81 
 
 
488 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.9 
 
 
489 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.33 
 
 
479 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.47 
 
 
489 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  44.11 
 
 
489 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0598  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.68 
 
 
492 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.83 
 
 
483 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.28 
 
 
496 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.92 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.9 
 
 
489 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.9 
 
 
489 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  45.74 
 
 
485 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.61 
 
 
483 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.9 
 
 
489 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.75 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
488 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>