More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1533 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  75.93 
 
 		 488 aa  773    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1533  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 484 aa  993    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  75.93 
 
 		 488 aa  772    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  61.92 
 
 		 483 aa  598  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.13 
 
 		 483 aa  601  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.97 
 
 		 483 aa  599  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.15 
 
 		 479 aa  592  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.37 
 
 		 479 aa  592  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.71 
 
 		 486 aa  588  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.07 
 
 		 482 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.16 
 
 		 479 aa  589  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.28 
 
 		 482 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.51 
 
 		 490 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.07 
 
 		 482 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.65 
 
 		 482 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.07 
 
 		 482 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.69 
 
 		 486 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.44 
 
 		 482 aa  580  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  57.02 
 
 		 482 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.02 
 
 		 482 aa  578  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.81 
 
 		 484 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  57.02 
 
 		 482 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.65 
 
 		 484 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.02 
 
 		 482 aa  578  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.89 
 
 		 482 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.02 
 
 		 482 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.02 
 
 		 482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 		 486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.81 
 
 		 482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.6 
 
 		 482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.16 
 
 		 509 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.49 
 
 		 486 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.81 
 
 		 482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.74 
 
 		 484 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  57.86 
 
 		 482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.95 
 
 		 493 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.81 
 
 		 482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.81 
 
 		 482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.86 
 
 		 489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  57.86 
 
 		 489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.23 
 
 		 480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.95 
 
 		 499 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  57.86 
 
 		 489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.95 
 
 		 499 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  59 
 
 		 486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.7 
 
 		 484 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.51 
 
 		 490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  57.86 
 
 		 489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.07 
 
 		 483 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  57.86 
 
 		 489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.79 
 
 		 480 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.6 
 
 		 480 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  57.65 
 
 		 489 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  57.86 
 
 		 489 aa  571  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.02 
 
 		 483 aa  571  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.07 
 
 		 485 aa  567  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.44 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  57.89 
 
 		 482 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.44 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.37 
 
 		 500 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.65 
 
 		 485 aa  567  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.24 
 
 		 492 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.46 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.44 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.39 
 
 		 483 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0428  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.91 
 
 		 486 aa  568  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.44 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.21 
 
 		 493 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.81 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.47 
 
 		 482 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.26 
 
 		 482 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.39 
 
 		 483 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.47 
 
 		 482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.02 
 
 		 493 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.18 
 
 		 482 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.39 
 
 		 489 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.02 
 
 		 485 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.35 
 
 		 489 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.44 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.6 
 
 		 489 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.14 
 
 		 483 aa  558  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.6 
 
 		 489 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.39 
 
 		 489 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.6 
 
 		 489 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.67 
 
 		 500 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.71 
 
 		 502 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.05 
 
 		 488 aa  556  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.77 
 
 		 489 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.46 
 
 		 500 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2637  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  58.33 
 
 		 480 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.03 
 
 		 485 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.9 
 
 		 486 aa  551  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0134  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.77 
 
 		 495 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.28 
 
 		 486 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.42 
 
 		 488 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.25 
 
 		 503 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.81 
 
 		 484 aa  541  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  54.74 
 
 		 480 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.86 
 
 		 486 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.83 
 
 		 503 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>