More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0692 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 477 aa  949    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.96 
 
 		 493 aa  537  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  59.7 
 
 		 492 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  56.84 
 
 		 487 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 		 495 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.75 
 
 		 487 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.11 
 
 		 486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.89 
 
 		 497 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  56.38 
 
 		 485 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.74 
 
 		 484 aa  495  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  57.17 
 
 		 491 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.04 
 
 		 489 aa  481  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  52.98 
 
 		 490 aa  478  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  52.74 
 
 		 496 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  51.69 
 
 		 487 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.52 
 
 		 493 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.72 
 
 		 489 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  53.8 
 
 		 487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.14 
 
 		 482 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.26 
 
 		 487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.04 
 
 		 459 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.26 
 
 		 500 aa  467  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  51.27 
 
 		 487 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.03 
 
 		 482 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  51.48 
 
 		 491 aa  463  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  54.03 
 
 		 476 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.24 
 
 		 482 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  49.46 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  53.36 
 
 		 502 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2112  Aldehyde Dehydrogenase  52.74 
 
 		 486 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00293848  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  52.09 
 
 		 489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 		 489 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.54 
 
 		 485 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.75 
 
 		 483 aa  450  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  52.75 
 
 		 482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  53.89 
 
 		 488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4076  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.87 
 
 		 500 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  46.91 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.81 
 
 		 480 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  53.15 
 
 		 499 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1858  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  53.18 
 
 		 485 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.88 
 
 		 514 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.48 
 
 		 480 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.45 
 
 		 483 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  48.3 
 
 		 482 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  46.48 
 
 		 482 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.7 
 
 		 482 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.02 
 
 		 480 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.48 
 
 		 482 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.81 
 
 		 482 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.6 
 
 		 482 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  46.48 
 
 		 482 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.76 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.48 
 
 		 482 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.81 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.6 
 
 		 483 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.02 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.7 
 
 		 482 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.6 
 
 		 482 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.38 
 
 		 483 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.48 
 
 		 482 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.08 
 
 		 488 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.04 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.37 
 
 		 482 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.81 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.38 
 
 		 482 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.81 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.64 
 
 		 481 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.07 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.2 
 
 		 484 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.23 
 
 		 479 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05360  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.15 
 
 		 495 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0233509  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.22 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.91 
 
 		 490 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.58 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  49.26 
 
 		 491 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.58 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.68 
 
 		 486 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.63 
 
 		 493 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.58 
 
 		 502 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.83 
 
 		 486 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.82 
 
 		 479 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.97 
 
 		 489 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.89 
 
 		 484 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.35 
 
 		 493 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.6 
 
 		 485 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.45 
 
 		 482 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.61 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.52 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.71 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.73 
 
 		 488 aa  415  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.12 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.67 
 
 		 489 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8160  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  44.78 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.71 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.82 
 
 		 503 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.35 
 
 		 492 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.45 
 
 		 489 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>