More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1207 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_05360  succinate semialdehyde dehydrogenase  67.41 
 
 
495 aa  649    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0233509  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  94.19 
 
 
499 aa  864    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  67.15 
 
 
490 aa  652    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  71.66 
 
 
502 aa  693    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  67.14 
 
 
496 aa  657    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
514 aa  1028    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  88.59 
 
 
493 aa  858    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.41 
 
 
487 aa  619  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  64.95 
 
 
487 aa  616  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.89 
 
 
489 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.96 
 
 
489 aa  608  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  63.41 
 
 
485 aa  598  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  62.96 
 
 
491 aa  593  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.54 
 
 
484 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  63.22 
 
 
488 aa  578  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  61.9 
 
 
487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  61.38 
 
 
487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.59 
 
 
497 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.39 
 
 
485 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  60.74 
 
 
487 aa  556  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  57.26 
 
 
489 aa  548  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.32 
 
 
490 aa  544  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  61.84 
 
 
482 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  61.84 
 
 
482 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  61.55 
 
 
476 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.1 
 
 
500 aa  528  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.91 
 
 
489 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  60.96 
 
 
482 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.81 
 
 
486 aa  512  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  54.68 
 
 
487 aa  511  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1858  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  60.8 
 
 
485 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.52 
 
 
493 aa  510  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  57.66 
 
 
483 aa  507  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.39 
 
 
492 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.26 
 
 
495 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  55.27 
 
 
491 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4076  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.23 
 
 
500 aa  485  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.99 
 
 
477 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  51.39 
 
 
482 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
502 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.24 
 
 
486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2112  Aldehyde Dehydrogenase  51.63 
 
 
486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00293848  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
489 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
489 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.25 
 
 
499 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.25 
 
 
499 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.93 
 
 
489 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  49.46 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.29 
 
 
489 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.87 
 
 
492 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
479 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.48 
 
 
484 aa  458  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
489 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.39 
 
 
493 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.63 
 
 
479 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
489 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
489 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
480 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.78 
 
 
490 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.94 
 
 
489 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  48.29 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  50.32 
 
 
491 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.29 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.4 
 
 
489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  48.29 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.4 
 
 
489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.29 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.29 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.4 
 
 
489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  48.4 
 
 
489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.86 
 
 
482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.4 
 
 
489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.29 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.96 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.3 
 
 
490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.86 
 
 
482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.86 
 
 
482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.7 
 
 
486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.08 
 
 
482 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.86 
 
 
480 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.16 
 
 
481 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.19 
 
 
489 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.08 
 
 
482 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.85 
 
 
484 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.43 
 
 
486 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.32 
 
 
500 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
488 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.74 
 
 
496 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.65 
 
 
482 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.76 
 
 
480 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2652  aldehyde dehydrogenase  46.2 
 
 
500 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.65 
 
 
480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.64 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.82 
 
 
484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.33 
 
 
491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.22 
 
 
486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.9 
 
 
500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.63 
 
 
503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>