More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0243 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  71.58 
 
 
493 aa  726    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  100 
 
 
492 aa  999    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  65.97 
 
 
491 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.07 
 
 
495 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  61.87 
 
 
487 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  65.47 
 
 
486 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.35 
 
 
487 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  56.93 
 
 
485 aa  541  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.7 
 
 
477 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  55.67 
 
 
496 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.87 
 
 
482 aa  513  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  54.6 
 
 
487 aa  505  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  51.28 
 
 
481 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.96 
 
 
493 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.98 
 
 
489 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  53.1 
 
 
490 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.67 
 
 
497 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.27 
 
 
484 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.89 
 
 
487 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.51 
 
 
459 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.53 
 
 
489 aa  487  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.7 
 
 
485 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  55.03 
 
 
502 aa  483  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  51.7 
 
 
487 aa  481  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  52.98 
 
 
491 aa  478  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.6 
 
 
500 aa  474  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
489 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  55.25 
 
 
499 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.95 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  49.48 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  52.64 
 
 
489 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.42 
 
 
483 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.95 
 
 
482 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  52.35 
 
 
487 aa  458  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.79 
 
 
480 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.95 
 
 
482 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.21 
 
 
480 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2112  Aldehyde Dehydrogenase  51.8 
 
 
486 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00293848  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
490 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
493 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
492 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.16 
 
 
483 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  53.53 
 
 
488 aa  455  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.74 
 
 
482 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.95 
 
 
482 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.16 
 
 
483 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  46.32 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.74 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.74 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  53.21 
 
 
482 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48 
 
 
480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.32 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.53 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  53.21 
 
 
482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.79 
 
 
480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  53.21 
 
 
476 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  46.32 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.39 
 
 
514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.32 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.53 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48 
 
 
480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.54 
 
 
500 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05360  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
495 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0233509  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.78 
 
 
483 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.99 
 
 
479 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.53 
 
 
479 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  49.9 
 
 
491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.58 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.05 
 
 
484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.12 
 
 
500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  53.63 
 
 
482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.28 
 
 
485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  49.79 
 
 
497 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.58 
 
 
484 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.16 
 
 
486 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2257  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.93 
 
 
490 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.142739  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.74 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
500 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0134  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
495 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.85 
 
 
489 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.79 
 
 
486 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
490 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.9 
 
 
492 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.25 
 
 
502 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.54 
 
 
483 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.35 
 
 
509 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.93 
 
 
496 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1858  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  52.56 
 
 
485 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  48 
 
 
489 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.7 
 
 
490 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4076  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
500 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
492 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.38 
 
 
490 aa  428  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  45.98 
 
 
489 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2081  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.89 
 
 
498 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
501 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.58 
 
 
484 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.86 
 
 
479 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>