More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1228 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
489 aa  957    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.24 
 
 
490 aa  672    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  66.87 
 
 
489 aa  618  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  63.41 
 
 
490 aa  591  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.49 
 
 
487 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  58.3 
 
 
485 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.83 
 
 
493 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  58.84 
 
 
487 aa  544  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  57.8 
 
 
496 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.48 
 
 
497 aa  529  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.38 
 
 
489 aa  525  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.83 
 
 
489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  57.17 
 
 
487 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.93 
 
 
484 aa  510  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  53.99 
 
 
491 aa  502  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.26 
 
 
514 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  55.7 
 
 
487 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.08 
 
 
486 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  57.38 
 
 
499 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.3 
 
 
487 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.38 
 
 
485 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.89 
 
 
493 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  55.19 
 
 
502 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  55.81 
 
 
487 aa  491  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  58.2 
 
 
488 aa  491  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.85 
 
 
495 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05360  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.35 
 
 
495 aa  481  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0233509  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.49 
 
 
500 aa  478  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.13 
 
 
482 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  53.93 
 
 
482 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  53.96 
 
 
476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4076  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.73 
 
 
500 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  52.64 
 
 
492 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.13 
 
 
482 aa  465  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  50.52 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.85 
 
 
483 aa  455  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1858  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  53.37 
 
 
485 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.92 
 
 
482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.47 
 
 
480 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.09 
 
 
493 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.88 
 
 
477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.2 
 
 
481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.72 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.38 
 
 
483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
489 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  50.74 
 
 
489 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.53 
 
 
489 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
489 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
489 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  50.31 
 
 
491 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
489 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
489 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  51.15 
 
 
491 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.81 
 
 
484 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
486 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
481 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.83 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.62 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.81 
 
 
486 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.5 
 
 
479 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.35 
 
 
490 aa  435  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2652  aldehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
500 aa  438  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.66 
 
 
488 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2112  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 
486 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00293848  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.51 
 
 
487 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.67 
 
 
492 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.4 
 
 
503 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.85 
 
 
500 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.88 
 
 
480 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.16 
 
 
489 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.76 
 
 
509 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.29 
 
 
479 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.12 
 
 
499 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.09 
 
 
489 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.47 
 
 
490 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.12 
 
 
499 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
483 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.15 
 
 
482 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.35 
 
 
480 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.57 
 
 
480 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.62 
 
 
492 aa  428  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.15 
 
 
482 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
488 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.15 
 
 
482 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.07 
 
 
502 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.17 
 
 
500 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.94 
 
 
479 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
492 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.83 
 
 
496 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
493 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.77 
 
 
483 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.35 
 
 
480 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.17 
 
 
500 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  47.15 
 
 
482 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
484 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.56 
 
 
483 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.26 
 
 
489 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.15 
 
 
482 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>