More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1526 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  70.1 
 
 
490 aa  665    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
489 aa  958    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  66.87 
 
 
489 aa  617  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  61.62 
 
 
490 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.51 
 
 
487 aa  559  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.62 
 
 
484 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  57.88 
 
 
485 aa  538  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  57.26 
 
 
487 aa  522  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  57.05 
 
 
496 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.48 
 
 
489 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.47 
 
 
493 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.45 
 
 
489 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.98 
 
 
497 aa  501  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  56.28 
 
 
487 aa  497  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  56.72 
 
 
487 aa  495  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.47 
 
 
487 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
493 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  54.77 
 
 
502 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  59.16 
 
 
488 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.81 
 
 
486 aa  475  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.91 
 
 
485 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.91 
 
 
514 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.17 
 
 
500 aa  475  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  52.6 
 
 
491 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  51.27 
 
 
487 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  54.07 
 
 
499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.85 
 
 
492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.91 
 
 
483 aa  465  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3095  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.27 
 
 
491 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  54.74 
 
 
476 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.95 
 
 
482 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.74 
 
 
482 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  51.06 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.34 
 
 
459 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.15 
 
 
495 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  47.99 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.99 
 
 
482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.99 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.99 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  47.35 
 
 
481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.78 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  47.99 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.99 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.78 
 
 
482 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.69 
 
 
493 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.76 
 
 
503 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05360  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.79 
 
 
495 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0233509  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.96 
 
 
503 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
489 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
490 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.53 
 
 
490 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.36 
 
 
483 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.46 
 
 
482 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.63 
 
 
492 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.38 
 
 
482 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.57 
 
 
482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.57 
 
 
482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.96 
 
 
486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  50.32 
 
 
489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.25 
 
 
482 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.7 
 
 
486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
484 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.05 
 
 
482 aa  445  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.28 
 
 
484 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.85 
 
 
481 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50 
 
 
483 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
480 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.2 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.2 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.94 
 
 
483 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.28 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  53.68 
 
 
482 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
488 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.52 
 
 
483 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.06 
 
 
499 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
482 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
489 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.61 
 
 
487 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  49.36 
 
 
480 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.06 
 
 
499 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
486 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.01 
 
 
479 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.8 
 
 
479 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.67 
 
 
485 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.67 
 
 
480 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.94 
 
 
484 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.78 
 
 
480 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.45 
 
 
489 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
489 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.62 
 
 
485 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.62 
 
 
485 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
489 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>