More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2949 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  71.52 
 
 		 485 aa  695    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 489 aa  991    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  73.39 
 
 		 487 aa  726    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  74.23 
 
 		 487 aa  699    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  66.94 
 
 		 484 aa  634  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  65.37 
 
 		 491 aa  620  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.65 
 
 		 493 aa  609  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.74 
 
 		 497 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  63.43 
 
 		 487 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  61.55 
 
 		 496 aa  598  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  60.16 
 
 		 490 aa  597  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  63.09 
 
 		 499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 		 489 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  63.37 
 
 		 488 aa  569  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.89 
 
 		 514 aa  570  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  59.63 
 
 		 502 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  59.75 
 
 		 487 aa  560  1e-158  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.21 
 
 		 485 aa  555  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  59.47 
 
 		 487 aa  555  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.93 
 
 		 493 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  60.17 
 
 		 482 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.7 
 
 		 486 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  59.96 
 
 		 482 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  60.08 
 
 		 476 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  57.38 
 
 		 489 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05360  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.91 
 
 		 495 aa  533  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0233509  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  59.75 
 
 		 482 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.64 
 
 		 490 aa  525  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1858  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  60.38 
 
 		 485 aa  527  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.94 
 
 		 500 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  55.25 
 
 		 487 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.45 
 
 		 489 aa  521  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.58 
 
 		 495 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  55.05 
 
 		 482 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4076  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.85 
 
 		 500 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  53.98 
 
 		 492 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  54.55 
 
 		 491 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.15 
 
 		 500 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.27 
 
 		 483 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.94 
 
 		 500 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.95 
 
 		 483 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.97 
 
 		 480 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.7 
 
 		 493 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.97 
 
 		 480 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.97 
 
 		 480 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.45 
 
 		 483 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.69 
 
 		 482 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  51.69 
 
 		 482 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  54.2 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.66 
 
 		 480 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.48 
 
 		 480 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.48 
 
 		 482 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.38 
 
 		 482 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.69 
 
 		 482 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.08 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.38 
 
 		 482 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.48 
 
 		 482 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.38 
 
 		 482 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  51.69 
 
 		 482 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.38 
 
 		 482 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.27 
 
 		 482 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.27 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.77 
 
 		 481 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.27 
 
 		 482 aa  488  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.81 
 
 		 480 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.95 
 
 		 486 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.76 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.8 
 
 		 488 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.63 
 
 		 482 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.62 
 
 		 485 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.79 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.53 
 
 		 484 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.95 
 
 		 493 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.07 
 
 		 479 aa  475  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.07 
 
 		 479 aa  475  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.33 
 
 		 485 aa  475  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 482 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.49 
 
 		 492 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  49.04 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.69 
 
 		 486 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.04 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 		 493 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.06 
 
 		 490 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2534  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.49 
 
 		 486 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.13 
 
 		 484 aa  472  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.81 
 
 		 493 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 482 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.64 
 
 		 489 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4025  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.7 
 
 		 493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.577209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.48 
 
 		 490 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.26 
 
 		 486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.36 
 
 		 489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.35 
 
 		 491 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 479 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 		 482 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.9 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 		 482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>