More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1116 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  74.12 
 
 
459 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
482 aa  961    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.26 
 
 
493 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  55.87 
 
 
492 aa  507  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.82 
 
 
487 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  55.7 
 
 
487 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  54.13 
 
 
485 aa  488  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.51 
 
 
486 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.33 
 
 
497 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.51 
 
 
495 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  55.14 
 
 
491 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  50.97 
 
 
487 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.63 
 
 
489 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.51 
 
 
487 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.49 
 
 
485 aa  448  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.17 
 
 
493 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  47.26 
 
 
481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.14 
 
 
477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.38 
 
 
489 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
500 aa  444  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.85 
 
 
490 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  52.92 
 
 
489 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  51.42 
 
 
496 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.55 
 
 
484 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2112  Aldehyde Dehydrogenase  49.37 
 
 
486 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00293848  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  50.88 
 
 
490 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.71 
 
 
493 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.55 
 
 
489 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.54 
 
 
482 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.65 
 
 
482 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1858  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.76 
 
 
485 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  51.32 
 
 
502 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.74 
 
 
482 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4076  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
500 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  48.54 
 
 
476 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  48.46 
 
 
487 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.7 
 
 
481 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.74 
 
 
480 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.52 
 
 
480 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  47.83 
 
 
487 aa  410  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.52 
 
 
480 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.52 
 
 
480 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  45.97 
 
 
482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  45.97 
 
 
482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.19 
 
 
482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.41 
 
 
482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  47.38 
 
 
482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.19 
 
 
482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  45.97 
 
 
482 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.96 
 
 
514 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  45.97 
 
 
482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  47.62 
 
 
491 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  45.75 
 
 
483 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  45.63 
 
 
482 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  50.53 
 
 
499 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2081  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
498 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0496  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.39 
 
 
486 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  45.41 
 
 
482 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  45.41 
 
 
482 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2346  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.34 
 
 
495 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.259477  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  45.41 
 
 
482 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  45.22 
 
 
480 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  45 
 
 
480 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.55 
 
 
483 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  50.54 
 
 
488 aa  398  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.03 
 
 
483 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.87 
 
 
482 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.88 
 
 
483 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
488 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.66 
 
 
483 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  45.47 
 
 
483 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  45.47 
 
 
483 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  45.47 
 
 
483 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.44 
 
 
480 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  45.47 
 
 
483 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  45.47 
 
 
483 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.47 
 
 
483 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  45.25 
 
 
483 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  48.28 
 
 
483 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.28 
 
 
479 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  45.03 
 
 
483 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4025  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.13 
 
 
493 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.577209  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
489 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
489 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  45.03 
 
 
483 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1951  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.34 
 
 
489 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
489 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
489 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.9 
 
 
496 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  45.03 
 
 
483 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.58 
 
 
493 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
490 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  46.09 
 
 
489 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2652  aldehyde dehydrogenase  44.06 
 
 
500 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.49 
 
 
482 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
500 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.32 
 
 
487 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
492 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.64 
 
 
484 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>