More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0496 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0496  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 486 aa  997    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2346  succinic semialdehyde dehydrogenase  67.22 
 
 		 495 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.259477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.96 
 
 		 491 aa  658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0062  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.54 
 
 		 492 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1485  succinate semialdehyde dehydrogenase  67.71 
 
 		 490 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464618  hitchhiker  0.00159215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.96 
 
 		 501 aa  650    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0768  succinate semialdehyde dehydrogenase  66.6 
 
 		 492 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823565  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5639  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.87 
 
 		 492 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2081  succinate semialdehyde dehydrogenase  69.17 
 
 		 498 aa  650    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3067  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.52 
 
 		 508 aa  631  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0865866  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1951  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.28 
 
 		 489 aa  624  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6109  succinic semialdehyde dehydrogenase  66.25 
 
 		 490 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.949426 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6346  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  65.42 
 
 		 490 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6049  aldehyde dehydrogenase  65.62 
 
 		 490 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.719916 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6452  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  65.83 
 
 		 490 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6687  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  65.83 
 
 		 490 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6572  aldehyde dehydrogenase  65.42 
 
 		 490 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6284  aldehyde dehydrogenase  65.62 
 
 		 490 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.709699  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1611  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  65.23 
 
 		 493 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0291547  decreased coverage  0.00849486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.91 
 
 		 493 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5862  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.77 
 
 		 485 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211994  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.51 
 
 		 486 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.04 
 
 		 482 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.83 
 
 		 482 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.83 
 
 		 482 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.25 
 
 		 489 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.83 
 
 		 482 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.46 
 
 		 489 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.46 
 
 		 489 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  55.46 
 
 		 489 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.46 
 
 		 489 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.46 
 
 		 489 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.79 
 
 		 482 aa  531  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  55.58 
 
 		 482 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.37 
 
 		 482 aa  529  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  55.58 
 
 		 482 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.27 
 
 		 480 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.15 
 
 		 483 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.67 
 
 		 489 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.37 
 
 		 482 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.58 
 
 		 482 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.58 
 
 		 482 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.58 
 
 		 482 aa  531  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.27 
 
 		 489 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.85 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.78 
 
 		 481 aa  525  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.67 
 
 		 503 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.89 
 
 		 493 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.93 
 
 		 482 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.64 
 
 		 480 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.43 
 
 		 480 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.72 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.67 
 
 		 503 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.64 
 
 		 489 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.72 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.06 
 
 		 488 aa  522  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.64 
 
 		 480 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.72 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.64 
 
 		 489 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.72 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.64 
 
 		 480 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.62 
 
 		 482 aa  524  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.64 
 
 		 489 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.97 
 
 		 484 aa  518  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  53.99 
 
 		 480 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.57 
 
 		 480 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.6 
 
 		 483 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.22 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.12 
 
 		 496 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.22 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03829  succinate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  53.57 
 
 		 531 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.8 
 
 		 489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.25 
 
 		 479 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5024  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.46 
 
 		 485 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.54 
 
 		 479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.65 
 
 		 489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.04 
 
 		 479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.62 
 
 		 492 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.67 
 
 		 482 aa  512  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.89 
 
 		 484 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4025  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.35 
 
 		 493 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.577209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.68 
 
 		 486 aa  511  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.95 
 
 		 486 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.83 
 
 		 483 aa  512  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.62 
 
 		 479 aa  512  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.73 
 
 		 482 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.38 
 
 		 490 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.09 
 
 		 492 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.17 
 
 		 500 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.73 
 
 		 484 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.6 
 
 		 483 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.47 
 
 		 488 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4416  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.41 
 
 		 485 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.49 
 
 		 486 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  52.65 
 
 		 482 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.22 
 
 		 489 aa  508  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.97 
 
 		 484 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.61 
 
 		 493 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.04 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.51 
 
 		 483 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>