More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1611 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2346  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.61 
 
 		 495 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.259477  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1611  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  100 
 
 		 493 aa  989    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0291547  decreased coverage  0.00849486 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6049  aldehyde dehydrogenase  80.08 
 
 		 490 aa  723    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.719916 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.97 
 
 		 491 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1951  succinic semialdehyde dehydrogenase  71.19 
 
 		 489 aa  647    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5639  succinic semialdehyde dehydrogenase  69.7 
 
 		 492 aa  658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3067  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.44 
 
 		 508 aa  641    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0865866  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6284  aldehyde dehydrogenase  81.44 
 
 		 490 aa  721    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.709699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0062  succinate semialdehyde dehydrogenase  69.78 
 
 		 492 aa  671    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6572  aldehyde dehydrogenase  84.79 
 
 		 490 aa  771    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1485  succinate semialdehyde dehydrogenase  83.12 
 
 		 490 aa  788    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464618  hitchhiker  0.00159215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  70.83 
 
 		 501 aa  662    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0768  succinate semialdehyde dehydrogenase  80.49 
 
 		 492 aa  778    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823565  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6109  succinic semialdehyde dehydrogenase  81.44 
 
 		 490 aa  775    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.949426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6452  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  81.65 
 
 		 490 aa  725    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6346  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  79.88 
 
 		 490 aa  730    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6687  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  81.65 
 
 		 490 aa  725    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2081  succinate semialdehyde dehydrogenase  71.25 
 
 		 498 aa  666    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0496  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.23 
 
 		 486 aa  624  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.85 
 
 		 493 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.76 
 
 		 503 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.97 
 
 		 503 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.67 
 
 		 485 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.46 
 
 		 485 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.18 
 
 		 486 aa  542  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.59 
 
 		 484 aa  541  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.25 
 
 		 479 aa  541  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  55.26 
 
 		 482 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.26 
 
 		 482 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.45 
 
 		 480 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.38 
 
 		 479 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.26 
 
 		 482 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.05 
 
 		 482 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.05 
 
 		 482 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.5 
 
 		 509 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.26 
 
 		 482 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.45 
 
 		 480 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  55.26 
 
 		 482 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.05 
 
 		 482 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.12 
 
 		 483 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.45 
 
 		 480 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.39 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.96 
 
 		 481 aa  538  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.53 
 
 		 486 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.64 
 
 		 482 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.03 
 
 		 493 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.64 
 
 		 482 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.83 
 
 		 480 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.64 
 
 		 482 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.4 
 
 		 480 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1778  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.41 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.29 
 
 		 484 aa  534  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.23 
 
 		 482 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.62 
 
 		 492 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.24 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.89 
 
 		 483 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.12 
 
 		 493 aa  531  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.89 
 
 		 489 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.85 
 
 		 489 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2636  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.67 
 
 		 488 aa  528  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.68 
 
 		 489 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.89 
 
 		 489 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.89 
 
 		 483 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.89 
 
 		 489 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.89 
 
 		 489 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0134  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.12 
 
 		 495 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1978  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.2 
 
 		 496 aa  531  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.44 
 
 		 492 aa  528  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  54.89 
 
 		 489 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.3 
 
 		 484 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.21 
 
 		 480 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.47 
 
 		 489 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0598  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.04 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.03 
 
 		 483 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.03 
 
 		 483 aa  526  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.14 
 
 		 493 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.12 
 
 		 488 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53 
 
 		 480 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.1 
 
 		 500 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.75 
 
 		 484 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.94 
 
 		 492 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.26 
 
 		 489 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.28 
 
 		 496 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.01 
 
 		 489 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8160  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  54.02 
 
 		 494 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.22 
 
 		 489 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.08 
 
 		 492 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.01 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.07 
 
 		 482 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  53.62 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.55 
 
 		 484 aa  521  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.87 
 
 		 482 aa  519  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.31 
 
 		 484 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4701  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.29 
 
 		 490 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.64 
 
 		 483 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.83 
 
 		 483 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.28 
 
 		 482 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.07 
 
 		 482 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.01 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.28 
 
 		 482 aa  521  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>