More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4757 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  74.23 
 
 
489 aa  714    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  71.04 
 
 
487 aa  693    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  70.69 
 
 
485 aa  681    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
487 aa  977    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.32 
 
 
497 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  66.11 
 
 
491 aa  608  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  63.6 
 
 
487 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.75 
 
 
484 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  61 
 
 
493 aa  591  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  59.5 
 
 
490 aa  580  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  60.37 
 
 
496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  62.32 
 
 
499 aa  567  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  63.75 
 
 
485 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  60.17 
 
 
502 aa  558  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.78 
 
 
493 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.9 
 
 
514 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  58.28 
 
 
487 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  57.11 
 
 
487 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4076  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.87 
 
 
500 aa  541  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.11 
 
 
489 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  60.87 
 
 
488 aa  538  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  57.17 
 
 
495 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.3 
 
 
490 aa  531  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  61.01 
 
 
482 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  61.22 
 
 
482 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  61.83 
 
 
476 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  55.86 
 
 
487 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1858  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  60.59 
 
 
485 aa  519  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  60.38 
 
 
482 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  57.47 
 
 
491 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.47 
 
 
489 aa  511  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.53 
 
 
500 aa  514  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.28 
 
 
486 aa  510  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  55.3 
 
 
489 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  50.64 
 
 
481 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  55.89 
 
 
492 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05360  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.45 
 
 
495 aa  500  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0233509  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.69 
 
 
483 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.91 
 
 
482 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  50.84 
 
 
482 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.06 
 
 
482 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.84 
 
 
482 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.84 
 
 
482 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.69 
 
 
482 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.69 
 
 
482 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.85 
 
 
482 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  50.84 
 
 
482 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.64 
 
 
482 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.53 
 
 
500 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.69 
 
 
482 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.64 
 
 
482 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.53 
 
 
500 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  52.14 
 
 
482 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.22 
 
 
483 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.17 
 
 
480 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.17 
 
 
480 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.72 
 
 
483 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.31 
 
 
483 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.11 
 
 
486 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.17 
 
 
480 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.9 
 
 
483 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.21 
 
 
480 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.96 
 
 
480 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.63 
 
 
492 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.26 
 
 
477 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
480 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.11 
 
 
480 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
482 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.38 
 
 
493 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
481 aa  475  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
482 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
482 aa  477  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
482 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
482 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.59 
 
 
499 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
486 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.59 
 
 
499 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
482 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
502 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
482 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.51 
 
 
482 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  52.53 
 
 
497 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.45 
 
 
488 aa  468  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.17 
 
 
503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.85 
 
 
488 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.23 
 
 
488 aa  468  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.96 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  52.64 
 
 
491 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
493 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
490 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
484 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2534  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.87 
 
 
486 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
484 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.41 
 
 
486 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
490 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.88 
 
 
490 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.27 
 
 
493 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.54 
 
 
486 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>