More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4419 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  90.46 
 
 
482 aa  796    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  69.18 
 
 
487 aa  639    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1858  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  89.75 
 
 
485 aa  775    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  100 
 
 
482 aa  967    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  99.59 
 
 
482 aa  966    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  99.79 
 
 
476 aa  954    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.29 
 
 
487 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  62.05 
 
 
487 aa  592  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  61.17 
 
 
485 aa  581  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.16 
 
 
484 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  61.59 
 
 
491 aa  562  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.67 
 
 
493 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  59.12 
 
 
490 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.13 
 
 
483 aa  551  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  62.66 
 
 
485 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 
487 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  62.89 
 
 
488 aa  542  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.42 
 
 
497 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.28 
 
 
489 aa  537  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  58.49 
 
 
496 aa  537  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  55.95 
 
 
487 aa  525  1e-148  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  55.34 
 
 
487 aa  521  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  61.64 
 
 
499 aa  522  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  59.62 
 
 
502 aa  521  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.22 
 
 
493 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.84 
 
 
514 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.15 
 
 
490 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.73 
 
 
500 aa  518  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.6 
 
 
495 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  53.93 
 
 
489 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  52.95 
 
 
481 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.93 
 
 
486 aa  501  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.74 
 
 
489 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4076  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.24 
 
 
500 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05360  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.11 
 
 
495 aa  493  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0233509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.03 
 
 
477 aa  488  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  53.21 
 
 
492 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.89 
 
 
482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  49.68 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
482 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.47 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  49.68 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  52.21 
 
 
491 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  50.64 
 
 
482 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
481 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.68 
 
 
482 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.68 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.47 
 
 
482 aa  464  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2112  Aldehyde Dehydrogenase  50.53 
 
 
486 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00293848  normal  0.162574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50 
 
 
483 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.05 
 
 
492 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.57 
 
 
480 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50 
 
 
480 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.33 
 
 
491 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
496 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.66 
 
 
488 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.43 
 
 
483 aa  458  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.57 
 
 
483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.73 
 
 
493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.11 
 
 
480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.56 
 
 
493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.54 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.11 
 
 
480 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.93 
 
 
482 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
486 aa  450  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.64 
 
 
479 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.89 
 
 
480 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.93 
 
 
482 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.93 
 
 
482 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
482 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.15 
 
 
482 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.57 
 
 
483 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
484 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
487 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.68 
 
 
480 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1888  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.77 
 
 
485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000160423  normal  0.0242248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.43 
 
 
479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.07 
 
 
488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.31 
 
 
484 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.39 
 
 
490 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.33 
 
 
486 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
500 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.76 
 
 
486 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
489 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8160  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  47.68 
 
 
494 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
459 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.5 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.25 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.34 
 
 
509 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
492 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
499 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2652  aldehyde dehydrogenase  46.84 
 
 
500 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
499 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.07 
 
 
483 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.094172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>