More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3929 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2023  succinate-semialdehyde dehydrogenase  77.57 
 
 		 490 aa  754    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.491893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4665  succinate-semialdehyde dehydrogenase  77.57 
 
 		 494 aa  748    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3929  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 489 aa  991    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1888  succinic semialdehyde dehydrogenase  75.66 
 
 		 485 aa  756    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000160423  normal  0.0242248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3863  succinic semialdehyde dehydrogenase  82.41 
 
 		 485 aa  804    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3173  succinic semialdehyde dehydrogenase  80.98 
 
 		 485 aa  799    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.79 
 
 		 489 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.16 
 
 		 489 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.16 
 
 		 489 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.16 
 
 		 489 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.16 
 
 		 489 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  62.16 
 
 		 489 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  61.95 
 
 		 489 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.75 
 
 		 489 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  61.19 
 
 		 500 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  61.95 
 
 		 489 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.54 
 
 		 489 aa  614  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 		 486 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.91 
 
 		 489 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.79 
 
 		 484 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.54 
 
 		 489 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.54 
 
 		 489 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.54 
 
 		 489 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  60.37 
 
 		 482 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.37 
 
 		 482 aa  610  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.58 
 
 		 482 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  60.37 
 
 		 482 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.37 
 
 		 482 aa  608  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.37 
 
 		 482 aa  608  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.37 
 
 		 482 aa  608  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60 
 
 		 483 aa  608  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.71 
 
 		 483 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.17 
 
 		 482 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.44 
 
 		 488 aa  604  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.91 
 
 		 496 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  59.92 
 
 		 482 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.75 
 
 		 482 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.75 
 
 		 482 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  60.71 
 
 		 480 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.75 
 
 		 482 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.54 
 
 		 482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 		 482 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.54 
 
 		 482 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.88 
 
 		 483 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.13 
 
 		 482 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 482 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.34 
 
 		 483 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.75 
 
 		 482 aa  599  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 482 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.7 
 
 		 490 aa  597  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.97 
 
 		 493 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.52 
 
 		 509 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.14 
 
 		 489 aa  595  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.5 
 
 		 488 aa  597  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.08 
 
 		 492 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.84 
 
 		 482 aa  596  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.33 
 
 		 492 aa  592  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.38 
 
 		 479 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.87 
 
 		 486 aa  592  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.93 
 
 		 493 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.17 
 
 		 479 aa  592  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.93 
 
 		 492 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.13 
 
 		 480 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.96 
 
 		 484 aa  591  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.51 
 
 		 480 aa  589  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.08 
 
 		 486 aa  591  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.26 
 
 		 493 aa  591  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.84 
 
 		 490 aa  588  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.88 
 
 		 482 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.13 
 
 		 480 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.42 
 
 		 480 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.96 
 
 		 479 aa  586  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.84 
 
 		 480 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.46 
 
 		 492 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.13 
 
 		 480 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.88 
 
 		 486 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.7 
 
 		 485 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.18 
 
 		 483 aa  587  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.49 
 
 		 485 aa  587  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.38 
 
 		 486 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.13 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1012  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.25 
 
 		 511 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225997  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.13 
 
 		 502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.29 
 
 		 484 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  58.84 
 
 		 480 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 		 489 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.13 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  58 
 
 		 490 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.09 
 
 		 488 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.71 
 
 		 484 aa  581  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.81 
 
 		 492 aa  580  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.41 
 
 		 493 aa  581  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.67 
 
 		 482 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.02 
 
 		 487 aa  581  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.53 
 
 		 490 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.62 
 
 		 503 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.84 
 
 		 486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.04 
 
 		 481 aa  577  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.82 
 
 		 503 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.46 
 
 		 482 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>