More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1443 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  100 
 
 
522 aa  1073    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.71 
 
 
510 aa  363  5.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.66 
 
 
551 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  41.35 
 
 
533 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  42.17 
 
 
531 aa  348  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.92 
 
 
479 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.92 
 
 
479 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  40.53 
 
 
518 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 
505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 
505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 
505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
540 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
526 aa  325  1e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.52 
 
 
517 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.17 
 
 
540 aa  324  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  38.51 
 
 
521 aa  323  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  41.98 
 
 
509 aa  323  5e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.88 
 
 
521 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.48 
 
 
493 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  40.51 
 
 
480 aa  319  7.999999999999999e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  41.41 
 
 
512 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.48 
 
 
483 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.26 
 
 
483 aa  316  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.26 
 
 
483 aa  316  6e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.26 
 
 
483 aa  316  6e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.04 
 
 
483 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.04 
 
 
483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.83 
 
 
483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
483 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.83 
 
 
489 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.83 
 
 
489 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.83 
 
 
489 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.83 
 
 
489 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.83 
 
 
489 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.18 
 
 
518 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
480 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.83 
 
 
489 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.13 
 
 
482 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.83 
 
 
483 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.83 
 
 
489 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1608  aldehyde dehydrogenase  38.9 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.91 
 
 
486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.61 
 
 
483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.91 
 
 
482 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.25 
 
 
550 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.48 
 
 
485 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
499 aa  310  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.91 
 
 
482 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.91 
 
 
482 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.26 
 
 
485 aa  310  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
454 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  38.23 
 
 
489 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 
489 aa  309  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.43 
 
 
525 aa  309  9e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  38.91 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.91 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  39.7 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  38.91 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.91 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.82 
 
 
480 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.12 
 
 
492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.82 
 
 
480 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.12 
 
 
493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.7 
 
 
482 aa  307  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.7 
 
 
482 aa  307  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.82 
 
 
480 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.7 
 
 
482 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.45 
 
 
538 aa  306  6e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.29 
 
 
492 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.26 
 
 
483 aa  306  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.95 
 
 
483 aa  306  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.26 
 
 
541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.6 
 
 
480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.96 
 
 
455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 
489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
500 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.82 
 
 
483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  37.78 
 
 
516 aa  304  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0768  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.05 
 
 
492 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823565  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.69 
 
 
484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
500 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.26 
 
 
492 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  38.82 
 
 
482 aa  303  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 
475 aa  302  9e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 
494 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.09 
 
 
484 aa  302  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.91 
 
 
493 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.84 
 
 
496 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6109  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.26 
 
 
490 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.949426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.16 
 
 
483 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
486 aa  301  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
496 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.99 
 
 
484 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.72 
 
 
486 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.17 
 
 
481 aa  300  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  37.95 
 
 
493 aa  300  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
509 aa  300  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  41.24 
 
 
481 aa  300  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>