More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0137 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
517 aa  1044    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  68.09 
 
 
516 aa  688    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.28 
 
 
518 aa  638    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  48.35 
 
 
533 aa  488  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.81 
 
 
534 aa  478  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  51.05 
 
 
521 aa  478  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.58 
 
 
525 aa  478  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  48.05 
 
 
531 aa  475  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.29 
 
 
540 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
518 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.42 
 
 
550 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.38 
 
 
541 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.41 
 
 
538 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
521 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.13 
 
 
551 aa  433  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  51.24 
 
 
540 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.76 
 
 
537 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  51.12 
 
 
534 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.79 
 
 
526 aa  414  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.77 
 
 
517 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
519 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.89 
 
 
525 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  46.14 
 
 
547 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.43 
 
 
510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.33 
 
 
522 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  40.82 
 
 
505 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  40.82 
 
 
505 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  40.82 
 
 
505 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  40.39 
 
 
509 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  40.82 
 
 
512 aa  295  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  38.13 
 
 
484 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
482 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1856  aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
505 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.24 
 
 
492 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  35.41 
 
 
497 aa  263  6e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.73 
 
 
493 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1516  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.29 
 
 
498 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.394302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
488 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  35.21 
 
 
510 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  35.57 
 
 
504 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.47 
 
 
489 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
482 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
482 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
482 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.96 
 
 
484 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  35.55 
 
 
493 aa  256  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  36.01 
 
 
494 aa  256  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.44 
 
 
483 aa  256  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
482 aa  256  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  34.7 
 
 
505 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.02 
 
 
489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.68 
 
 
493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  36.61 
 
 
483 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.19 
 
 
484 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.12 
 
 
500 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.84 
 
 
488 aa  254  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.02 
 
 
489 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2692  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.52 
 
 
498 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.68 
 
 
486 aa  253  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  33.05 
 
 
490 aa  253  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.95 
 
 
490 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03829  succinate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  34.06 
 
 
531 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.04 
 
 
482 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
494 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.11 
 
 
484 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.1 
 
 
494 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.9 
 
 
500 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.19 
 
 
486 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.6 
 
 
495 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2771  aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 
498 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
494 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
494 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
494 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.42 
 
 
484 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
494 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  36.56 
 
 
499 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.89 
 
 
486 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.38 
 
 
480 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.88 
 
 
494 aa  251  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.79 
 
 
489 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.79 
 
 
489 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.79 
 
 
489 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.79 
 
 
489 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  34.9 
 
 
491 aa  250  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
494 aa  250  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6540  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.7 
 
 
484 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.142006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.88 
 
 
494 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  34.67 
 
 
485 aa  249  7e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.28 
 
 
483 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.45 
 
 
489 aa  249  9e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.41 
 
 
488 aa  249  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.11 
 
 
492 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.66 
 
 
494 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3929  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.03 
 
 
489 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  34 
 
 
480 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  34.9 
 
 
489 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.04 
 
 
494 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.3 
 
 
485 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  34.45 
 
 
482 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>