More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38020 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 499 aa  995    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  64.26 
 
 		 505 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2558  Aldehyde Dehydrogenase  63.1 
 
 		 496 aa  591  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141176  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  64.14 
 
 		 481 aa  568  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3908  Aldehyde Dehydrogenase  59.28 
 
 		 498 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1683  putative aldehyde dehydrogenase  62.27 
 
 		 494 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5460  Aldehyde Dehydrogenase  60.86 
 
 		 510 aa  547  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4001  aldehyde dehydrogenase  62.71 
 
 		 498 aa  529  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4187  Aldehyde Dehydrogenase  58.98 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  60.45 
 
 		 503 aa  525  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  60.17 
 
 		 501 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2940  aldehyde dehydrogenase  53.43 
 
 		 548 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  50.73 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2784  aldehyde dehydrogenase  60.59 
 
 		 581 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  53.25 
 
 		 508 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2501  aldehyde dehydrogenase  59.48 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.7 
 
 		 510 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.48 
 
 		 522 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  41.65 
 
 		 510 aa  317  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  45.22 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  43.16 
 
 		 512 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  40.81 
 
 		 531 aa  295  9e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  41.89 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  41.89 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  41.89 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20445  predicted protein  37.18 
 
 		 524 aa  286  5.999999999999999e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2095  aldehyde dehydrogenase  39.21 
 
 		 516 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  38.1 
 
 		 516 aa  277  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  38.65 
 
 		 521 aa  274  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  37.37 
 
 		 533 aa  274  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  36.23 
 
 		 484 aa  269  8e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  35.5 
 
 		 502 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.88 
 
 		 521 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05870  meiotic recombination-related protein, putative  34.26 
 
 		 631 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.137863  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.63 
 
 		 518 aa  267  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.19 
 
 		 483 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.29 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  35.14 
 
 		 493 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 540 aa  264  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  39.14 
 
 		 505 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  36.23 
 
 		 494 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.34 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  37.69 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  37.69 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 		 518 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.35 
 
 		 483 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.51 
 
 		 482 aa  257  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.33 
 
 		 550 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.91 
 
 		 483 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.13 
 
 		 483 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.27 
 
 		 489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  34.13 
 
 		 483 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.27 
 
 		 489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.37 
 
 		 489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.98 
 
 		 496 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.91 
 
 		 483 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.91 
 
 		 483 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.91 
 
 		 483 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.81 
 
 		 486 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.15 
 
 		 491 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.95 
 
 		 483 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.69 
 
 		 483 aa  252  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.54 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  40 
 
 		 453 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.21 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31599  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.82 
 
 		 471 aa  252  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.69 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  36.91 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.99 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.38 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.29 
 
 		 479 aa  251  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  33.92 
 
 		 469 aa  251  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.29 
 
 		 483 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  36.77 
 
 		 505 aa  250  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0496  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.73 
 
 		 486 aa  250  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1321  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.89 
 
 		 443 aa  250  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  37.5 
 
 		 516 aa  250  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.99 
 
 		 476 aa  250  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.99 
 
 		 490 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  35.84 
 
 		 501 aa  249  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.93 
 
 		 480 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.87 
 
 		 482 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.22 
 
 		 493 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1749  lactaldehyde dehydrogenase  39.39 
 
 		 481 aa  249  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.451931  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  34.87 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.87 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  34.87 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  36.62 
 
 		 489 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.09 
 
 		 483 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.22 
 
 		 500 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.07 
 
 		 479 aa  248  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.72 
 
 		 480 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3957  aldehyde dehydrogenase  35.19 
 
 		 489 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.72 
 
 		 480 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0666  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.59 
 
 		 492 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.98 
 
 		 482 aa  246  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.4 
 
 		 480 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.72 
 
 		 480 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.77 
 
 		 461 aa  246  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.07 
 
 		 490 aa  246  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>