More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5460 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5460  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
510 aa  1033    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  59.55 
 
 
505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  60.86 
 
 
499 aa  557  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  58.23 
 
 
481 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2940  aldehyde dehydrogenase  56.35 
 
 
548 aa  537  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  60.73 
 
 
503 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2558  Aldehyde Dehydrogenase  56.03 
 
 
496 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4001  aldehyde dehydrogenase  57.95 
 
 
498 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3908  Aldehyde Dehydrogenase  56.42 
 
 
498 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1683  putative aldehyde dehydrogenase  57.43 
 
 
494 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  56.29 
 
 
501 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4187  Aldehyde Dehydrogenase  50.91 
 
 
496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2501  aldehyde dehydrogenase  55.85 
 
 
518 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169486  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  52.74 
 
 
499 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2784  aldehyde dehydrogenase  57.38 
 
 
581 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  50.61 
 
 
508 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  39.64 
 
 
510 aa  302  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.95 
 
 
510 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.82 
 
 
522 aa  296  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20445  predicted protein  36.71 
 
 
524 aa  283  6.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2095  aldehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  35.53 
 
 
521 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  40.1 
 
 
512 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.16 
 
 
551 aa  256  5e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  36.71 
 
 
505 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  36.71 
 
 
505 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  36.71 
 
 
505 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
509 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  36.34 
 
 
516 aa  251  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  34.85 
 
 
533 aa  249  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1321  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.41 
 
 
443 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.26 
 
 
483 aa  247  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  39.08 
 
 
453 aa  246  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.17 
 
 
540 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  34.48 
 
 
497 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0666  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.43 
 
 
492 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.36 
 
 
461 aa  239  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.05 
 
 
483 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.11 
 
 
496 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  35.68 
 
 
531 aa  238  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.74 
 
 
521 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.2 
 
 
484 aa  237  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.69 
 
 
483 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.36 
 
 
503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  33.33 
 
 
493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.48 
 
 
483 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.48 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.05 
 
 
483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  34.05 
 
 
483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.05 
 
 
483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
537 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  34.24 
 
 
505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.48 
 
 
483 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.77 
 
 
480 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.55 
 
 
480 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.55 
 
 
480 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.85 
 
 
482 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.76 
 
 
480 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.85 
 
 
482 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.48 
 
 
483 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  32.65 
 
 
490 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.95 
 
 
503 aa  233  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.55 
 
 
480 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.73 
 
 
550 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.85 
 
 
482 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.48 
 
 
483 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  33.55 
 
 
480 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.85 
 
 
482 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.92 
 
 
483 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
491 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.21 
 
 
483 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1978  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.47 
 
 
496 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90594  Meiotic Sister-Chromatid recombination aldehyde dehydrogenase  30.58 
 
 
616 aa  229  7e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.308604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.82 
 
 
480 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0883  aldehyde dehydrogenase  33.98 
 
 
453 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.93 
 
 
479 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
494 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.63 
 
 
482 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  33.63 
 
 
482 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.63 
 
 
482 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
491 aa  228  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05870  meiotic recombination-related protein, putative  32.2 
 
 
631 aa  227  3e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.137863  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  34.72 
 
 
517 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  33.63 
 
 
482 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.63 
 
 
482 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.26 
 
 
483 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
494 aa  228  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.63 
 
 
482 aa  227  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.72 
 
 
479 aa  227  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4701  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.33 
 
 
490 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.41 
 
 
482 aa  226  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  33.55 
 
 
518 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  33.48 
 
 
494 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.41 
 
 
482 aa  226  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1778  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.04 
 
 
496 aa  226  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.21 
 
 
538 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  35.19 
 
 
496 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  33.48 
 
 
494 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
482 aa  226  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  33.05 
 
 
494 aa  226  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>