More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3633 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 540 aa  1099    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  52.23 
 
 		 521 aa  531  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.46 
 
 		 525 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.83 
 
 		 521 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  52.26 
 
 		 533 aa  509  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  52.82 
 
 		 518 aa  511  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.55 
 
 		 550 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.38 
 
 		 534 aa  494  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.17 
 
 		 538 aa  487  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  54 
 
 		 541 aa  485  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  47.83 
 
 		 531 aa  482  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.17 
 
 		 537 aa  480  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  52.73 
 
 		 516 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.15 
 
 		 551 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 		 518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  52.29 
 
 		 517 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  53 
 
 		 540 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.75 
 
 		 519 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  51.8 
 
 		 534 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.34 
 
 		 517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.49 
 
 		 526 aa  399  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  47.11 
 
 		 547 aa  392  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.7 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.43 
 
 		 510 aa  325  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.31 
 
 		 522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  39.84 
 
 		 512 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 		 505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 		 505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 		 505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.26 
 
 		 485 aa  306  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.19 
 
 		 486 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.52 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.15 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.15 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.15 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.15 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.24 
 
 		 496 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.77 
 
 		 482 aa  296  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.39 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.42 
 
 		 484 aa  295  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.55 
 
 		 482 aa  294  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.55 
 
 		 482 aa  294  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  37.55 
 
 		 482 aa  294  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  37.55 
 
 		 482 aa  294  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.55 
 
 		 482 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.55 
 
 		 482 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.88 
 
 		 489 aa  293  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  36.86 
 
 		 505 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.02 
 
 		 483 aa  293  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.34 
 
 		 482 aa  292  9e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.5 
 
 		 480 aa  292  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.28 
 
 		 483 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.67 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  40.56 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.29 
 
 		 489 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.98 
 
 		 493 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.07 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.29 
 
 		 489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.29 
 
 		 489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.29 
 
 		 489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.29 
 
 		 489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.29 
 
 		 489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 		 484 aa  290  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3036  aldehyde dehydrogenase  38.43 
 
 		 488 aa  289  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.53 
 
 		 484 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.12 
 
 		 483 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 493 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.25 
 
 		 480 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.12 
 
 		 480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.07 
 
 		 489 aa  287  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.12 
 
 		 480 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.12 
 
 		 480 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.47 
 
 		 488 aa  286  8e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.91 
 
 		 480 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.55 
 
 		 480 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.85 
 
 		 485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.64 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  37 
 
 		 484 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.8 
 
 		 493 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.34 
 
 		 482 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1533  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.1 
 
 		 484 aa  283  7.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.12 
 
 		 482 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.72 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.12 
 
 		 482 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.04 
 
 		 491 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.72 
 
 		 493 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.6 
 
 		 490 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  38.76 
 
 		 497 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.98 
 
 		 489 aa  281  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6540  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.72 
 
 		 484 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142006 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.75 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.82 
 
 		 494 aa  280  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.67 
 
 		 494 aa  280  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.07 
 
 		 485 aa  280  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.7 
 
 		 482 aa  280  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.91 
 
 		 499 aa  279  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.91 
 
 		 499 aa  279  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3342  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.89 
 
 		 492 aa  279  9e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.420157  normal  0.140471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>