More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2558 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  69.77 
 
 
505 aa  674    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2558  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
496 aa  1009    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  63.1 
 
 
499 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3908  Aldehyde Dehydrogenase  59.35 
 
 
498 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  59.67 
 
 
481 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1683  putative aldehyde dehydrogenase  60.81 
 
 
494 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4187  Aldehyde Dehydrogenase  57.46 
 
 
496 aa  531  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4001  aldehyde dehydrogenase  59.46 
 
 
498 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  58.4 
 
 
503 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  58.03 
 
 
501 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5460  Aldehyde Dehydrogenase  56.03 
 
 
510 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  50.42 
 
 
499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2940  aldehyde dehydrogenase  48.58 
 
 
548 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  53.76 
 
 
508 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2784  aldehyde dehydrogenase  52.95 
 
 
581 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2501  aldehyde dehydrogenase  52.69 
 
 
518 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169486  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.42 
 
 
522 aa  310  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.87 
 
 
510 aa  303  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  37.17 
 
 
510 aa  292  8e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  36.5 
 
 
533 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 
512 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  37.5 
 
 
531 aa  270  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2095  aldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 
516 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
509 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
505 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
505 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
505 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  35.56 
 
 
516 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20445  predicted protein  33.19 
 
 
524 aa  256  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181142  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
551 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  35.42 
 
 
521 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
526 aa  247  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.44 
 
 
538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.75 
 
 
521 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1321  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.43 
 
 
443 aa  244  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  33.76 
 
 
484 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  36.48 
 
 
518 aa  243  9e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.11 
 
 
540 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.7 
 
 
483 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.06 
 
 
483 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.36 
 
 
491 aa  239  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  35.37 
 
 
480 aa  239  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  35.06 
 
 
494 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  34.06 
 
 
483 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.38 
 
 
486 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.48 
 
 
483 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  35.74 
 
 
489 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.84 
 
 
483 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.84 
 
 
483 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.84 
 
 
483 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.41 
 
 
484 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  35.74 
 
 
489 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
550 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.2 
 
 
489 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.76 
 
 
494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.2 
 
 
489 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  36.94 
 
 
488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.16 
 
 
503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.84 
 
 
483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.06 
 
 
483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  33.76 
 
 
494 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  35.55 
 
 
494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  35.55 
 
 
494 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2003  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.76 
 
 
496 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000861925 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  35.55 
 
 
494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.78 
 
 
493 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.95 
 
 
503 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2905  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.01 
 
 
494 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.35 
 
 
492 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1608  aldehyde dehydrogenase  33.56 
 
 
443 aa  233  5e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  35.43 
 
 
494 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  35.9 
 
 
501 aa  233  7.000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1344  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.24 
 
 
488 aa  233  8.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  33.12 
 
 
494 aa  232  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.97 
 
 
483 aa  233  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.62 
 
 
483 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  34.69 
 
 
494 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  35.12 
 
 
494 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  34.11 
 
 
517 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
484 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  32.68 
 
 
493 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  38.13 
 
 
547 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  33.33 
 
 
494 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.45 
 
 
500 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  35.04 
 
 
505 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  32.75 
 
 
469 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  34.8 
 
 
496 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.57 
 
 
541 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  35.05 
 
 
535 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  33.55 
 
 
494 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.69 
 
 
494 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.05 
 
 
488 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.33 
 
 
518 aa  231  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  34.26 
 
 
494 aa  231  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
484 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.33 
 
 
483 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  33.12 
 
 
494 aa  230  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  33.12 
 
 
494 aa  230  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0496  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.29 
 
 
486 aa  230  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  33.12 
 
 
494 aa  230  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>