More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2940 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2940  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
548 aa  1093    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5460  Aldehyde Dehydrogenase  56.35 
 
 
510 aa  527  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2784  aldehyde dehydrogenase  62.65 
 
 
581 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  53.21 
 
 
505 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2501  aldehyde dehydrogenase  58.52 
 
 
518 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169486  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  53.43 
 
 
499 aa  472  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3908  Aldehyde Dehydrogenase  50.1 
 
 
498 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  54.7 
 
 
501 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  53.3 
 
 
481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4187  Aldehyde Dehydrogenase  49.89 
 
 
496 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2558  Aldehyde Dehydrogenase  48.5 
 
 
496 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1683  putative aldehyde dehydrogenase  49.8 
 
 
494 aa  428  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  50.61 
 
 
503 aa  425  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4001  aldehyde dehydrogenase  51.21 
 
 
498 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  44.88 
 
 
499 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  50.53 
 
 
508 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.58 
 
 
510 aa  284  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.19 
 
 
522 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  37.94 
 
 
505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  37.94 
 
 
505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  37.94 
 
 
505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20445  predicted protein  36.08 
 
 
524 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  40.49 
 
 
512 aa  269  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  38.35 
 
 
509 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  35.89 
 
 
510 aa  259  8e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  35.45 
 
 
521 aa  256  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  41.14 
 
 
453 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.62 
 
 
503 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.81 
 
 
503 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.53 
 
 
461 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  35 
 
 
485 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.28 
 
 
551 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  35.71 
 
 
516 aa  241  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.68 
 
 
486 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.37 
 
 
480 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  35.38 
 
 
487 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.57 
 
 
485 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.37 
 
 
480 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.37 
 
 
480 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  34.81 
 
 
480 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.92 
 
 
484 aa  236  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.15 
 
 
480 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.4 
 
 
483 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0666  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.08 
 
 
492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.59 
 
 
480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  32.75 
 
 
493 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  37.34 
 
 
531 aa  235  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  33.2 
 
 
526 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.99 
 
 
483 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2095  aldehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
516 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  34.12 
 
 
484 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  34.23 
 
 
480 aa  234  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5862  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.05 
 
 
485 aa  234  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211994  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  31.75 
 
 
496 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1321  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.85 
 
 
443 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.31 
 
 
480 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.7 
 
 
480 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.79 
 
 
479 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.31 
 
 
489 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50750  predicted protein  34.12 
 
 
523 aa  233  8.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0113332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.85 
 
 
482 aa  233  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.85 
 
 
482 aa  233  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.85 
 
 
482 aa  233  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.02 
 
 
489 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.02 
 
 
489 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.02 
 
 
489 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.85 
 
 
482 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.02 
 
 
489 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.02 
 
 
489 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.23 
 
 
484 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.71 
 
 
486 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  34.8 
 
 
489 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.37 
 
 
484 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  35.28 
 
 
474 aa  231  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  33.55 
 
 
482 aa  230  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  33.55 
 
 
482 aa  230  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.26 
 
 
483 aa  230  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.55 
 
 
482 aa  230  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.55 
 
 
482 aa  230  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.04 
 
 
483 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.48 
 
 
483 aa  229  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.11 
 
 
483 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.77 
 
 
481 aa  229  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.02 
 
 
486 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.26 
 
 
482 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.8 
 
 
483 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.33 
 
 
482 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  34.36 
 
 
533 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1749  lactaldehyde dehydrogenase  36.94 
 
 
481 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.451931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
482 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.33 
 
 
482 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  32.44 
 
 
476 aa  227  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3036  aldehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
488 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  35.29 
 
 
467 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.36 
 
 
483 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31599  succinate semialdehyde dehydrogenase  32.7 
 
 
471 aa  227  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.04 
 
 
483 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.4 
 
 
493 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.62 
 
 
484 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.5 
 
 
489 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>