More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1749 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1749  lactaldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 481 aa  965    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.451931  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  51.63 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.61 
 
 		 476 aa  420  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.27 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  43.96 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.89 
 
 		 483 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1783  aldehyde dehydrogenase  42.24 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  41.04 
 
 		 484 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.18 
 
 		 482 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.18 
 
 		 482 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.18 
 
 		 482 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.18 
 
 		 482 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  41.39 
 
 		 482 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.39 
 
 		 482 aa  363  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  41.39 
 
 		 482 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.39 
 
 		 482 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 482 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.39 
 
 		 482 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.18 
 
 		 482 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.42 
 
 		 482 aa  361  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.84 
 
 		 490 aa  360  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.97 
 
 		 482 aa  360  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.54 
 
 		 509 aa  359  7e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.87 
 
 		 483 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.21 
 
 		 482 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.21 
 
 		 482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.21 
 
 		 482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.79 
 
 		 482 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  42.71 
 
 		 510 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.79 
 
 		 508 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  42.5 
 
 		 505 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.79 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 		 504 aa  352  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.38 
 
 		 483 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  42.23 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.05 
 
 		 490 aa  351  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.41 
 
 		 493 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.53 
 
 		 482 aa  350  4e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.87 
 
 		 486 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.73 
 
 		 489 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.42 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.58 
 
 		 486 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.21 
 
 		 499 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.21 
 
 		 499 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  39.38 
 
 		 490 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.58 
 
 		 488 aa  346  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.21 
 
 		 480 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  42.02 
 
 		 483 aa  346  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  39.87 
 
 		 502 aa  345  8e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.21 
 
 		 480 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.96 
 
 		 483 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  37.63 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.74 
 
 		 486 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.54 
 
 		 489 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.04 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.97 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  40.89 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.21 
 
 		 485 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.95 
 
 		 482 aa  343  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.42 
 
 		 486 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  41.26 
 
 		 483 aa  342  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.45 
 
 		 484 aa  342  5.999999999999999e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  40.67 
 
 		 485 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 		 494 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.29 
 
 		 480 aa  342  9e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.66 
 
 		 484 aa  342  9e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.37 
 
 		 480 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3136  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.08 
 
 		 483 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2142  Aldehyde Dehydrogenase  39.09 
 
 		 486 aa  342  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.74 
 
 		 486 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.79 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.83 
 
 		 492 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.21 
 
 		 482 aa  340  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.8 
 
 		 489 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.34 
 
 		 496 aa  340  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.42 
 
 		 482 aa  340  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.8 
 
 		 489 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.8 
 
 		 489 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.8 
 
 		 489 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.8 
 
 		 489 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.8 
 
 		 489 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.54 
 
 		 490 aa  339  8e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 		 488 aa  339  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.59 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.63 
 
 		 489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  37.21 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.87 
 
 		 485 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  41.79 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1602  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase I (NADP+) (SSDH)  40.79 
 
 		 479 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.49 
 
 		 501 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.83 
 
 		 490 aa  336  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.96 
 
 		 491 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 492 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.7 
 
 		 479 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.96 
 
 		 494 aa  336  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.7 
 
 		 493 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 493 aa  335  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>