More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1760 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  100 
 
 		 461 aa  917    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  49.67 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1749  lactaldehyde dehydrogenase  51.63 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.451931  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  47.91 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.02 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.05 
 
 		 476 aa  386  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.64 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.08 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  45.08 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1783  aldehyde dehydrogenase  42.2 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.83 
 
 		 487 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 488 aa  359  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  42.42 
 
 		 502 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.15 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.54 
 
 		 493 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.89 
 
 		 496 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  43.7 
 
 		 490 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.2 
 
 		 468 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 483 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 		 492 aa  345  7e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.62 
 
 		 489 aa  345  8e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.62 
 
 		 489 aa  345  8e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 		 484 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.1 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  44.12 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.1 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  40.61 
 
 		 488 aa  343  4e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.88 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  43.04 
 
 		 490 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  40.61 
 
 		 488 aa  342  7e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.88 
 
 		 480 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.44 
 
 		 482 aa  342  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.28 
 
 		 480 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.93 
 
 		 483 aa  342  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.5 
 
 		 480 aa  342  9e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.44 
 
 		 482 aa  342  9e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  40.44 
 
 		 482 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.44 
 
 		 482 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.44 
 
 		 482 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  40.44 
 
 		 482 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.44 
 
 		 482 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  42.6 
 
 		 467 aa  342  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.44 
 
 		 482 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  41.92 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.11 
 
 		 479 aa  339  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  42.11 
 
 		 505 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.06 
 
 		 480 aa  339  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.44 
 
 		 480 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  40.48 
 
 		 493 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  42.01 
 
 		 494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  40.79 
 
 		 493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.52 
 
 		 486 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4032  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.12 
 
 		 481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 		 482 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0828  hypothetical protein  42.16 
 
 		 455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  40.22 
 
 		 508 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  42.7 
 
 		 472 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.27 
 
 		 483 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  42.07 
 
 		 494 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.44 
 
 		 486 aa  335  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.98 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.4 
 
 		 482 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.4 
 
 		 482 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  40.52 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  41.45 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1602  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase I (NADP+) (SSDH)  44.62 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.85 
 
 		 494 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.74 
 
 		 490 aa  335  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.4 
 
 		 482 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 		 494 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 		 494 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 		 494 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 489 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 489 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 489 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 		 494 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.85 
 
 		 494 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.78 
 
 		 482 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 489 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.78 
 
 		 482 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.63 
 
 		 489 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.85 
 
 		 494 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  43.24 
 
 		 480 aa  333  4e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.4 
 
 		 482 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.41 
 
 		 489 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.56 
 
 		 482 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.06 
 
 		 483 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.1 
 
 		 492 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  39.43 
 
 		 496 aa  333  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3194  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.15 
 
 		 453 aa  332  7.000000000000001e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 496 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.56 
 
 		 482 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.66 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.52 
 
 		 489 aa  332  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0912  Aldehyde Dehydrogenase  42.07 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0440933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.88 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.84 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>