More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0828 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0828  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  927    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1783  aldehyde dehydrogenase  47.73 
 
 
471 aa  431  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.8 
 
 
476 aa  421  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  44.4 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.41 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.86 
 
 
476 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.16 
 
 
461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.43 
 
 
484 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.43 
 
 
486 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1749  lactaldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
481 aa  319  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.451931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
471 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1856  aldehyde dehydrogenase  40.66 
 
 
505 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.87 
 
 
498 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  39.82 
 
 
483 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
482 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.28 
 
 
468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.99 
 
 
496 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.82 
 
 
509 aa  306  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1377  Aldehyde Dehydrogenase  39.33 
 
 
506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162758  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1481  Aldehyde Dehydrogenase  39.02 
 
 
506 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450354  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  37.91 
 
 
502 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.07 
 
 
493 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  36.76 
 
 
488 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.43 
 
 
492 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
484 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.68 
 
 
485 aa  300  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.74 
 
 
488 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.77 
 
 
489 aa  300  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  37.37 
 
 
493 aa  299  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.46 
 
 
485 aa  299  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  37.78 
 
 
483 aa  299  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
486 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  37.99 
 
 
484 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  36.52 
 
 
488 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0874  aldehyde dehydrogenase  38 
 
 
504 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  39.31 
 
 
504 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.52 
 
 
488 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
490 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
484 aa  296  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  38.39 
 
 
493 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  38.07 
 
 
490 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  38.39 
 
 
493 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.92 
 
 
493 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2045  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  37.72 
 
 
506 aa  295  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  38.61 
 
 
493 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.9 
 
 
486 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
486 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.82 
 
 
480 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  37.63 
 
 
492 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05500  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.18 
 
 
479 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  37.75 
 
 
467 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.42 
 
 
482 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  36.87 
 
 
485 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  37.96 
 
 
493 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0364  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.53 
 
 
478 aa  293  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  38.43 
 
 
489 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
490 aa  293  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.82 
 
 
483 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  38.34 
 
 
490 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.62 
 
 
489 aa  293  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.21 
 
 
506 aa  293  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  38.26 
 
 
494 aa  293  6e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  38.95 
 
 
483 aa  293  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  37.67 
 
 
485 aa  293  6e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.2 
 
 
482 aa  292  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1967  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  37.5 
 
 
506 aa  292  7e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119766  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  38.43 
 
 
489 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
490 aa  292  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.69 
 
 
490 aa  292  8e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  37.2 
 
 
510 aa  292  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  38.39 
 
 
493 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  38.62 
 
 
485 aa  291  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.24 
 
 
482 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
482 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42872  predicted protein  38.39 
 
 
503 aa  291  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.701812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.24 
 
 
482 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.07 
 
 
488 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.98 
 
 
482 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  37.96 
 
 
493 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  36.52 
 
 
489 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.98 
 
 
482 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.98 
 
 
482 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  36.98 
 
 
482 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.98 
 
 
482 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.72 
 
 
495 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.6 
 
 
482 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
482 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  37.53 
 
 
478 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.77 
 
 
481 aa  290  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
490 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
496 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  38.44 
 
 
492 aa  290  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
482 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.25 
 
 
483 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.24 
 
 
492 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.06 
 
 
480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.24 
 
 
493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.06 
 
 
480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  37.77 
 
 
490 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.81 
 
 
489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>