More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0092 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  68.75 
 
 		 470 aa  666    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 467 aa  945    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  65.1 
 
 		 467 aa  625  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  63.09 
 
 		 471 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  63.17 
 
 		 467 aa  596  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  61.67 
 
 		 467 aa  589  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  56.53 
 
 		 467 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.82 
 
 		 470 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  55.89 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  54.09 
 
 		 472 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  55.19 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.32 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  51.39 
 
 		 475 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  52.36 
 
 		 468 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  52.24 
 
 		 474 aa  487  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  51.4 
 
 		 535 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  51.29 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  53.13 
 
 		 473 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  48.39 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  49.67 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  53.05 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  49.57 
 
 		 468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  50.85 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  49.47 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  48.19 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  45.61 
 
 		 479 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  45.08 
 
 		 486 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  47.64 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  44.44 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3186  aldehyde dehydrogenase  44.57 
 
 		 452 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  43.3 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  43.71 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  43.68 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  47.17 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.35 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1915  Aldehyde Dehydrogenase  47.22 
 
 		 477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00249538  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3616  Aldehyde Dehydrogenase  44.35 
 
 		 469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  41.4 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.19 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.65 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.65 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.15 
 
 		 500 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 		 488 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  40.98 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 500 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 500 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 500 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 500 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 500 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.6 
 
 		 461 aa  342  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2710  Aldehyde Dehydrogenase  44.98 
 
 		 467 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 476 aa  341  2e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.07 
 
 		 494 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 		 504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.28 
 
 		 494 aa  340  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.31 
 
 		 490 aa  339  7e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  39.07 
 
 		 488 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 		 487 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  38.81 
 
 		 495 aa  336  5.999999999999999e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1537  phenylacetaldehyde dehydrogenase  42.15 
 
 		 573 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  38.19 
 
 		 476 aa  335  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 		 480 aa  333  4e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 493 aa  332  6e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1274  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 500 aa  333  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2466  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 500 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0943  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0371587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1365  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0348  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0628  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.596423  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  41.42 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1201  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.32 
 
 		 500 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  38.69 
 
 		 508 aa  330  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 486 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  38.43 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 486 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  39.66 
 
 		 485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 486 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 486 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  38.43 
 
 		 494 aa  329  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  39.62 
 
 		 490 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 486 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.51 
 
 		 496 aa  328  9e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  38.43 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  39.41 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  38.43 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.22 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  39.37 
 
 		 492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  40.09 
 
 		 506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 		 497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1723  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 		 459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0635196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.22 
 
 		 494 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 		 497 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  41.08 
 
 		 497 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.58 
 
 		 505 aa  326  6e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  39.24 
 
 		 480 aa  326  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>