More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1024 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
471 aa  965    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  57.36 
 
 
475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  56.56 
 
 
479 aa  552  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  57.36 
 
 
474 aa  545  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  60.4 
 
 
477 aa  542  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  52.85 
 
 
478 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  51.5 
 
 
468 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  52.81 
 
 
470 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
467 aa  458  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  50.87 
 
 
484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  49.25 
 
 
535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  47.45 
 
 
473 aa  450  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  47.28 
 
 
479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  50.44 
 
 
467 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
472 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  46.35 
 
 
467 aa  438  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  49.14 
 
 
467 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  47.74 
 
 
471 aa  435  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  45.2 
 
 
446 aa  430  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.5 
 
 
467 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  44.87 
 
 
503 aa  425  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
468 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  48.25 
 
 
473 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  48.82 
 
 
467 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
472 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  46.42 
 
 
468 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 
470 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  46.44 
 
 
468 aa  415  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  45.51 
 
 
469 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.9 
 
 
469 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  43.83 
 
 
475 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
463 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
486 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3186  aldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 
452 aa  362  8e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
469 aa  353  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1915  Aldehyde Dehydrogenase  43.75 
 
 
477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00249538  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3616  Aldehyde Dehydrogenase  43.21 
 
 
469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.7 
 
 
461 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  40.59 
 
 
485 aa  332  6e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 
480 aa  325  8.000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.17 
 
 
500 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2710  Aldehyde Dehydrogenase  42.04 
 
 
467 aa  323  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 
512 aa  323  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
499 aa  323  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
500 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
500 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
500 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
481 aa  322  7e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  38.74 
 
 
473 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  38.28 
 
 
499 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  38.28 
 
 
499 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.54 
 
 
492 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  39.79 
 
 
510 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
500 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.2 
 
 
476 aa  319  7e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1472  phenylacetaldehyde dehydrogenase  38.06 
 
 
499 aa  319  7e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2270  phenylacetaldehyde dehydrogenase  38.06 
 
 
499 aa  319  7e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
500 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.55 
 
 
488 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01357  phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.85 
 
 
499 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01370  hypothetical protein  37.85 
 
 
499 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
488 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
488 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1783  aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 
471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
498 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
488 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.01 
 
 
494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  38.45 
 
 
497 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.01 
 
 
494 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
495 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.72 
 
 
496 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
495 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  36.23 
 
 
483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  37.88 
 
 
494 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  38.01 
 
 
508 aa  310  5e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  36.57 
 
 
496 aa  309  9e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.8 
 
 
494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  36.59 
 
 
494 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  38.11 
 
 
503 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  37.26 
 
 
494 aa  307  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  36.99 
 
 
494 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  36.93 
 
 
494 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  36.93 
 
 
494 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  36.63 
 
 
494 aa  306  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  36.63 
 
 
494 aa  306  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  36.59 
 
 
494 aa  306  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.72 
 
 
494 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  36.38 
 
 
494 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  36.63 
 
 
494 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  36.93 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06180  betaine aldehyde dehydrogenase  36.66 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.77 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  36.42 
 
 
494 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  36.42 
 
 
494 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
512 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  36.42 
 
 
494 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  36.5 
 
 
488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  36.42 
 
 
494 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>