More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5515 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 479 aa  978    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  56.32 
 
 		 471 aa  554  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  55.03 
 
 		 475 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  54.06 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  52.88 
 
 		 477 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  50.84 
 
 		 478 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  50.76 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  46.25 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  47.85 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  46.45 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  47.32 
 
 		 467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  48.92 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  49.34 
 
 		 471 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  47.74 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  45.61 
 
 		 467 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  46.94 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  49.78 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  46.14 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  46.87 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  47.2 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  45.09 
 
 		 473 aa  418  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  46.42 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.47 
 
 		 470 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  46.67 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  45.14 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.16 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  43.52 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  46.67 
 
 		 467 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  44.76 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  43.62 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  43.76 
 
 		 469 aa  363  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1915  Aldehyde Dehydrogenase  44.73 
 
 		 477 aa  360  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00249538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.42 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3616  Aldehyde Dehydrogenase  43.88 
 
 		 469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3186  aldehyde dehydrogenase  37.05 
 
 		 452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  41.96 
 
 		 504 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  41.07 
 
 		 485 aa  333  4e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2710  Aldehyde Dehydrogenase  44.75 
 
 		 467 aa  333  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.53 
 
 		 496 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  40.26 
 
 		 490 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.69 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.7 
 
 		 481 aa  325  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  39.83 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.32 
 
 		 488 aa  323  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  40.52 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.19 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  39.45 
 
 		 488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.15 
 
 		 480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.47 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.74 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.61 
 
 		 476 aa  319  7e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  37.09 
 
 		 502 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.21 
 
 		 500 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.3 
 
 		 476 aa  315  9e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 488 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  38.95 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  38.81 
 
 		 494 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.02 
 
 		 494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  38.46 
 
 		 497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 488 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  38.81 
 
 		 494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  36.48 
 
 		 495 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  36.48 
 
 		 495 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 		 496 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.24 
 
 		 494 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  38.56 
 
 		 497 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  35.92 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  38.59 
 
 		 494 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  38.59 
 
 		 494 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1783  aldehyde dehydrogenase  40.09 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  39.24 
 
 		 488 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.39 
 
 		 500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  39.02 
 
 		 496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.39 
 
 		 500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.39 
 
 		 500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  38.82 
 
 		 494 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  38.38 
 
 		 494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.35 
 
 		 498 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.39 
 
 		 500 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 		 494 aa  307  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 		 512 aa  306  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  37.39 
 
 		 473 aa  306  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  35.7 
 
 		 495 aa  305  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 		 487 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  38.56 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.55 
 
 		 490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  36.34 
 
 		 506 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  36.74 
 
 		 499 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  37.66 
 
 		 478 aa  303  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  37.29 
 
 		 494 aa  302  8.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  35.79 
 
 		 503 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  37.58 
 
 		 510 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.38 
 
 		 482 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.38 
 
 		 482 aa  302  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>