More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3297 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  66.17 
 
 
468 aa  635    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
468 aa  944    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
467 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  51.08 
 
 
535 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  51.96 
 
 
473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  50.76 
 
 
470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  48.06 
 
 
468 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
471 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  49.35 
 
 
468 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.58 
 
 
470 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  46.87 
 
 
467 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  48.81 
 
 
471 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  49.78 
 
 
479 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 
469 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  50.33 
 
 
472 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  48.04 
 
 
474 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  50.22 
 
 
472 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  47.83 
 
 
475 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  47.55 
 
 
467 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  46.52 
 
 
463 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  51.84 
 
 
467 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  49.25 
 
 
477 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.65 
 
 
467 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  47.73 
 
 
467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  48.94 
 
 
478 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  46.97 
 
 
484 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  46.37 
 
 
475 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2710  Aldehyde Dehydrogenase  51.32 
 
 
467 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
469 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
486 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  42.64 
 
 
473 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  42.43 
 
 
479 aa  366  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3186  aldehyde dehydrogenase  43.53 
 
 
452 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  48.87 
 
 
469 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3616  Aldehyde Dehydrogenase  48.87 
 
 
469 aa  347  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  41.06 
 
 
503 aa  344  2e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.7 
 
 
476 aa  344  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
476 aa  342  8e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1915  Aldehyde Dehydrogenase  47.76 
 
 
477 aa  342  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00249538  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  41.69 
 
 
446 aa  340  5e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
486 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
486 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
486 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
486 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
486 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  41.03 
 
 
476 aa  325  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1723  aldehyde dehydrogenase  43.65 
 
 
459 aa  319  6e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0635196  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  40.3 
 
 
504 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  43.02 
 
 
461 aa  316  7e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.13 
 
 
492 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  38.6 
 
 
503 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
496 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 
476 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  38.82 
 
 
513 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.37 
 
 
500 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.74 
 
 
480 aa  306  6e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
500 aa  306  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
475 aa  306  7e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3305  phenylacetaldehyde dehydrogenase  36.89 
 
 
494 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.72 
 
 
512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3474  phenylacetaldehyde dehydrogenase  36.68 
 
 
494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
492 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3379  phenylacetaldehyde dehydrogenase  36.68 
 
 
494 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.4 
 
 
489 aa  302  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3372  phenylacetaldehyde dehydrogenase  36.48 
 
 
494 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3300  phenylacetaldehyde dehydrogenase  36.48 
 
 
494 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0279  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 
484 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
501 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2917  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
479 aa  300  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  35.81 
 
 
493 aa  300  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.4 
 
 
501 aa  300  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.19 
 
 
496 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  38.63 
 
 
473 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  36.78 
 
 
506 aa  297  3e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4074  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.24 
 
 
499 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  40.52 
 
 
510 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38450  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
486 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  42.28 
 
 
501 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  37.67 
 
 
490 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3513  aldehyde dehydrogenase  37.02 
 
 
495 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.429335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  37.94 
 
 
499 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1008  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
477 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.8811  normal  0.211569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  40.3 
 
 
480 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1274  phenylacetaldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 
500 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1537  phenylacetaldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 
573 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1285  aldehyde dehydrogenase  40.53 
 
 
478 aa  294  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019381  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.34 
 
 
496 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
493 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 
474 aa  293  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1350  betaine aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
487 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259029  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  38.02 
 
 
497 aa  292  7e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.94 
 
 
494 aa  292  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  39.49 
 
 
494 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>