More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7686 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  81.43 
 
 
474 aa  798    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
475 aa  971    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  57.36 
 
 
471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  58.26 
 
 
484 aa  558  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  59.79 
 
 
478 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  55.03 
 
 
479 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  56.84 
 
 
477 aa  533  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  51.39 
 
 
467 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  54.76 
 
 
470 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  49.78 
 
 
471 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  50.96 
 
 
467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.18 
 
 
467 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  47.31 
 
 
467 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  47.77 
 
 
535 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.64 
 
 
470 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
467 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  51.29 
 
 
467 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  47.2 
 
 
468 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  48.92 
 
 
468 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  47.2 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  46.72 
 
 
479 aa  437  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  46.44 
 
 
468 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  47.7 
 
 
463 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  46.32 
 
 
473 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  47.97 
 
 
475 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  46.51 
 
 
446 aa  429  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  45.84 
 
 
503 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  46.61 
 
 
473 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  46.98 
 
 
472 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.22 
 
 
469 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  47.83 
 
 
468 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  44.57 
 
 
486 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3186  aldehyde dehydrogenase  42.08 
 
 
452 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  46.34 
 
 
469 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1915  Aldehyde Dehydrogenase  46.34 
 
 
477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00249538  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.71 
 
 
500 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
500 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
500 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 
500 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3616  Aldehyde Dehydrogenase  45.01 
 
 
469 aa  345  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
500 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
504 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.42 
 
 
476 aa  344  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
500 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  40.42 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.26 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.21 
 
 
492 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  40.7 
 
 
494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
494 aa  336  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.17 
 
 
494 aa  336  5e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  39.05 
 
 
490 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  38.7 
 
 
497 aa  332  8e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.23 
 
 
494 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.55 
 
 
494 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  38.28 
 
 
499 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.74 
 
 
496 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  38.9 
 
 
495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.8 
 
 
487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.17 
 
 
480 aa  327  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  39.33 
 
 
508 aa  326  7e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 
481 aa  325  9e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
494 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.41 
 
 
488 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
488 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1537  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 
573 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.4 
 
 
496 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1274  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 
500 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  38 
 
 
488 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  37.53 
 
 
473 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
488 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.88 
 
 
494 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  36.88 
 
 
494 aa  322  8e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  37.16 
 
 
494 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
488 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.31 
 
 
461 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2466  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
500 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1201  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.74 
 
 
494 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  36.74 
 
 
494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  36.95 
 
 
494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  36.74 
 
 
494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  38.77 
 
 
485 aa  320  5e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0348  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
500 aa  319  7e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1365  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
500 aa  319  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0628  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
500 aa  319  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.596423  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0943  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
500 aa  319  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0371587  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.74 
 
 
505 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  37.76 
 
 
502 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  37.84 
 
 
476 aa  317  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  38.03 
 
 
494 aa  317  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  37.21 
 
 
483 aa  316  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  37.6 
 
 
490 aa  315  8e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
501 aa  315  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  40.52 
 
 
495 aa  315  9.999999999999999e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  42.34 
 
 
421 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3304  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  36.83 
 
 
477 aa  314  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  36.95 
 
 
488 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.78 
 
 
498 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>