More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5135 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  81.8 
 
 		 467 aa  756    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 467 aa  947    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  60.34 
 
 		 467 aa  578  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  56.53 
 
 		 467 aa  564  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  57.76 
 
 		 470 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  53.25 
 
 		 472 aa  521  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.53 
 
 		 467 aa  522  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  56.28 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  53.22 
 
 		 471 aa  519  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.61 
 
 		 470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  54.19 
 
 		 467 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.18 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  46.25 
 
 		 479 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  47.31 
 
 		 475 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  46.24 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  46.6 
 
 		 468 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  46.35 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.91 
 
 		 468 aa  428  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  48.81 
 
 		 477 aa  425  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  44.83 
 
 		 474 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  46.38 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  46.87 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  41.5 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  43.71 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  45.2 
 
 		 478 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  41.54 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  44.37 
 
 		 503 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  42.53 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  41.24 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  43.78 
 
 		 484 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  42.19 
 
 		 475 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3186  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 		 452 aa  363  4e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  42.09 
 
 		 469 aa  351  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.61 
 
 		 476 aa  345  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1915  Aldehyde Dehydrogenase  44.3 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00249538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2710  Aldehyde Dehydrogenase  41.15 
 
 		 467 aa  333  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  38.59 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.27 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  39.17 
 
 		 499 aa  329  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3616  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 		 469 aa  328  9e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 		 500 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  38.95 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 500 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 500 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 500 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 		 497 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  39.31 
 
 		 497 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 		 497 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.53 
 
 		 500 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.05 
 
 		 476 aa  316  6e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 486 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.08 
 
 		 494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.08 
 
 		 476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.11 
 
 		 500 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 486 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 486 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 		 474 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 486 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  38.59 
 
 		 497 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 486 aa  312  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  36.5 
 
 		 494 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  34.67 
 
 		 493 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  38.66 
 
 		 497 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.71 
 
 		 494 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  35.59 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  36.5 
 
 		 494 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  36.5 
 
 		 494 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  36.5 
 
 		 494 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1552  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 		 479 aa  310  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154954  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1723  aldehyde dehydrogenase  42.3 
 
 		 459 aa  310  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0635196  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  36.73 
 
 		 480 aa  310  5e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.08 
 
 		 494 aa  310  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.5 
 
 		 494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3372  phenylacetaldehyde dehydrogenase  35.29 
 
 		 494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3305  phenylacetaldehyde dehydrogenase  35.29 
 
 		 494 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  37.42 
 
 		 490 aa  309  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3474  phenylacetaldehyde dehydrogenase  35.29 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  36.29 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  37 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3300  phenylacetaldehyde dehydrogenase  35.08 
 
 		 494 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  36.46 
 
 		 505 aa  307  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1783  aldehyde dehydrogenase  36.03 
 
 		 471 aa  306  6e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3379  phenylacetaldehyde dehydrogenase  35.08 
 
 		 494 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.23 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.44 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  36.97 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.79 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 		 488 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  35.65 
 
 		 494 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  36.08 
 
 		 476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.32 
 
 		 501 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  33.97 
 
 		 495 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  33.97 
 
 		 495 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  35.65 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.69 
 
 		 496 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>