More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3845 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  68.75 
 
 
467 aa  692    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  100 
 
 
470 aa  954    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  68.1 
 
 
467 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  64.01 
 
 
471 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  64.22 
 
 
467 aa  595  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  63.15 
 
 
467 aa  584  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  57.76 
 
 
467 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  57.48 
 
 
472 aa  557  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.94 
 
 
470 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  57.33 
 
 
467 aa  538  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  55.77 
 
 
472 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  54.76 
 
 
475 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  53.88 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 
469 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  51.93 
 
 
468 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  51.72 
 
 
535 aa  475  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  52.81 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  52.49 
 
 
473 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  48.18 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  50.64 
 
 
468 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  53.05 
 
 
477 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  51.29 
 
 
468 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  49.23 
 
 
463 aa  458  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  48.57 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  50.54 
 
 
468 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  47.2 
 
 
479 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  51.09 
 
 
484 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  49.68 
 
 
478 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  48.07 
 
 
475 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  46.25 
 
 
503 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  45.49 
 
 
446 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  45.14 
 
 
473 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  43.74 
 
 
479 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3186  aldehyde dehydrogenase  44.97 
 
 
452 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  47.76 
 
 
469 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3616  Aldehyde Dehydrogenase  46.7 
 
 
469 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1915  Aldehyde Dehydrogenase  48.93 
 
 
477 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00249538  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.96 
 
 
476 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 
476 aa  354  2e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.65 
 
 
476 aa  350  4e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 
500 aa  350  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1723  aldehyde dehydrogenase  45.81 
 
 
459 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0635196  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  43.17 
 
 
485 aa  344  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  43.7 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
495 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
500 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
500 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
500 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
500 aa  339  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  40.92 
 
 
476 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.94 
 
 
497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  39.92 
 
 
508 aa  336  5.999999999999999e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
474 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 
487 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  40.31 
 
 
473 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.53 
 
 
494 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  41.02 
 
 
490 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.91 
 
 
480 aa  334  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.02 
 
 
490 aa  333  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.53 
 
 
494 aa  333  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  39.11 
 
 
492 aa  332  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  39.1 
 
 
494 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
494 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.85 
 
 
488 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2710  Aldehyde Dehydrogenase  43.33 
 
 
467 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.42 
 
 
494 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  39.28 
 
 
488 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1274  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
500 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.89 
 
 
494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.45 
 
 
496 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.28 
 
 
490 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  38.89 
 
 
494 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  38.89 
 
 
494 aa  329  7e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  38.89 
 
 
494 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.89 
 
 
496 aa  329  8e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.89 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.48 
 
 
481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1365  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2466  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0943  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0371587  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1201  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
500 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0628  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.596423  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0348  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  38.64 
 
 
488 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1537  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
573 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.64 
 
 
488 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
486 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
486 aa  326  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.43 
 
 
488 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
486 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
486 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
486 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
486 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
494 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
486 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
486 aa  324  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  36.38 
 
 
493 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  38.38 
 
 
488 aa  322  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>