More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0153 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 470 aa  967    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  58.03 
 
 		 467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  54.82 
 
 		 467 aa  562  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.25 
 
 		 467 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  56.93 
 
 		 472 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  51.61 
 
 		 467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  51.94 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  53.1 
 
 		 467 aa  510  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  51.5 
 
 		 471 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  53.43 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  48.6 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  48.93 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  48.28 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  48.93 
 
 		 468 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  49.89 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  47.64 
 
 		 475 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  46.78 
 
 		 463 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  45.82 
 
 		 469 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  45.94 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.18 
 
 		 469 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  46.27 
 
 		 474 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  45.75 
 
 		 486 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  45.06 
 
 		 484 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  46.37 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  44.78 
 
 		 478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  43.47 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  44.02 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  41.63 
 
 		 473 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  44.16 
 
 		 475 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3186  aldehyde dehydrogenase  43.56 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  47.29 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  41.45 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  40.17 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  39.74 
 
 		 479 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3616  Aldehyde Dehydrogenase  47.04 
 
 		 469 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1915  Aldehyde Dehydrogenase  45.06 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00249538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2710  Aldehyde Dehydrogenase  41.78 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.83 
 
 		 476 aa  341  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  38.36 
 
 		 493 aa  335  9e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  37.23 
 
 		 485 aa  325  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.75 
 
 		 483 aa  323  5e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.64 
 
 		 490 aa  323  6e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.68 
 
 		 483 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.74 
 
 		 483 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.68 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.68 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.47 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 		 486 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 		 486 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.47 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.47 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.47 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.85 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 		 486 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  36.76 
 
 		 486 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.64 
 
 		 496 aa  319  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  36.76 
 
 		 486 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  37.45 
 
 		 510 aa  319  7.999999999999999e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  36.76 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  36.76 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.26 
 
 		 483 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  36.55 
 
 		 486 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.52 
 
 		 480 aa  317  4e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  37.84 
 
 		 473 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  37.13 
 
 		 476 aa  316  7e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.7 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  37.37 
 
 		 497 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 481 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.97 
 
 		 500 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  38.09 
 
 		 512 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.65 
 
 		 476 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  36.5 
 
 		 494 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  37.96 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.76 
 
 		 500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 		 497 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.76 
 
 		 500 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.57 
 
 		 501 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.55 
 
 		 500 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.55 
 
 		 500 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.55 
 
 		 500 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  37.82 
 
 		 503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  37.09 
 
 		 497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.23 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3372  phenylacetaldehyde dehydrogenase  36.21 
 
 		 494 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  36.52 
 
 		 490 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  38.24 
 
 		 517 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  36.29 
 
 		 495 aa  307  3e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38450  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.09 
 
 		 486 aa  307  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.23 
 
 		 494 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  37.18 
 
 		 501 aa  306  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3300  phenylacetaldehyde dehydrogenase  36.21 
 
 		 494 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3305  phenylacetaldehyde dehydrogenase  36.21 
 
 		 494 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 		 494 aa  305  9.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05560  lactaldehyde dehydrogenase  36.73 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.84 
 
 		 486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>