More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3432 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
474 aa  964    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  81.43 
 
 
475 aa  803    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  57.36 
 
 
471 aa  552  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  58.51 
 
 
478 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  56.69 
 
 
484 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  56.62 
 
 
477 aa  529  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  54.06 
 
 
479 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  52.24 
 
 
467 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  53.88 
 
 
470 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  52.45 
 
 
467 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  48.62 
 
 
535 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.67 
 
 
467 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  46.79 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  51.81 
 
 
467 aa  451  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  49.35 
 
 
471 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.27 
 
 
470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  48.71 
 
 
468 aa  444  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  47.05 
 
 
473 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  48.39 
 
 
467 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  46.87 
 
 
468 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 
467 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  46.68 
 
 
468 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  47.1 
 
 
472 aa  435  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  47.44 
 
 
475 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  45.57 
 
 
446 aa  429  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  45.7 
 
 
463 aa  425  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  45.85 
 
 
479 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.4 
 
 
469 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  44.68 
 
 
503 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  47.03 
 
 
473 aa  412  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  47.84 
 
 
468 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  46.77 
 
 
472 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  44.13 
 
 
486 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3186  aldehyde dehydrogenase  41.69 
 
 
452 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  45.09 
 
 
469 aa  351  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
504 aa  349  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1915  Aldehyde Dehydrogenase  46.01 
 
 
477 aa  346  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00249538  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 
494 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.98 
 
 
497 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.9 
 
 
490 aa  342  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
500 aa  339  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
500 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  39.92 
 
 
473 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.87 
 
 
494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
500 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
500 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
500 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  42.03 
 
 
494 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.2 
 
 
490 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.87 
 
 
494 aa  334  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
494 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  40.17 
 
 
508 aa  332  6e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
494 aa  332  8e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.76 
 
 
494 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.66 
 
 
494 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.04 
 
 
499 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
494 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
500 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.45 
 
 
494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 
494 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 
494 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3616  Aldehyde Dehydrogenase  43.61 
 
 
469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  39.02 
 
 
490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
480 aa  326  6e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  38.65 
 
 
495 aa  326  7e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  38.22 
 
 
510 aa  325  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  39.67 
 
 
492 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.95 
 
 
498 aa  325  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.63 
 
 
496 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
481 aa  324  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3304  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
477 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.49 
 
 
476 aa  323  6e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.4 
 
 
494 aa  323  6e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 
494 aa  322  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
493 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  38.63 
 
 
492 aa  322  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  39.49 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  39.4 
 
 
494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4012  Aldehyde Dehydrogenase  39.01 
 
 
508 aa  320  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1537  phenylacetaldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
573 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.4 
 
 
494 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
494 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
494 aa  320  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
494 aa  320  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.19 
 
 
494 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
494 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  39.28 
 
 
490 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.57 
 
 
482 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.01 
 
 
481 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 
476 aa  317  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
501 aa  317  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4237  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.89 
 
 
482 aa  316  5e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.279293 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.79 
 
 
499 aa  316  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.79 
 
 
499 aa  316  7e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  38.24 
 
 
485 aa  315  8e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
487 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  39.09 
 
 
493 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>