More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_31599 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_31599  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 471 aa  978    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.36 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  38.67 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1321  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.67 
 
 		 443 aa  292  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.17 
 
 		 483 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.42 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  36.26 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 		 484 aa  280  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.98 
 
 		 522 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0883  aldehyde dehydrogenase  38.62 
 
 		 453 aa  280  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.4 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.53 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.89 
 
 		 488 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.3 
 
 		 480 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.3 
 
 		 480 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.42 
 
 		 489 aa  276  8e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.49 
 
 		 479 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.57 
 
 		 480 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.78 
 
 		 500 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.15 
 
 		 495 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.05 
 
 		 482 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.02 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  34 
 
 		 500 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.27 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.14 
 
 		 491 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  35.87 
 
 		 510 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.42 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.19 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.54 
 
 		 485 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 486 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.72 
 
 		 486 aa  269  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.53 
 
 		 483 aa  269  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.44 
 
 		 486 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  36.3 
 
 		 488 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.53 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  34.75 
 
 		 482 aa  267  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.74 
 
 		 484 aa  267  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.64 
 
 		 486 aa  267  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.79 
 
 		 499 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.79 
 
 		 499 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1147  betaine aldehyde dehydrogenase  36.21 
 
 		 488 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  36.08 
 
 		 488 aa  266  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3136  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 		 483 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.02 
 
 		 480 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.19 
 
 		 492 aa  265  8.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  34.95 
 
 		 497 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3095  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.26 
 
 		 491 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.46 
 
 		 500 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.43 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.43 
 
 		 489 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.31 
 
 		 483 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1516  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.06 
 
 		 498 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.394302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1783  aldehyde dehydrogenase  36.24 
 
 		 471 aa  265  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  36.12 
 
 		 485 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  35.71 
 
 		 496 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.11 
 
 		 484 aa  264  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.28 
 
 		 490 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.69 
 
 		 480 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.95 
 
 		 484 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.8 
 
 		 483 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0563  betaine aldehyde dehydrogenase  35.78 
 
 		 487 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  0.578799 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.42 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 		 488 aa  263  6.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.05 
 
 		 486 aa  262  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  36.3 
 
 		 477 aa  262  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  35.38 
 
 		 479 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.49 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.59 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.38 
 
 		 479 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.51 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0890  betaine aldehyde dehydrogenase  36.7 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187132  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.49 
 
 		 482 aa  260  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  33.85 
 
 		 482 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0777  betaine aldehyde dehydrogenase  35.91 
 
 		 487 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549042  normal  0.0734216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.51 
 
 		 493 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  33.85 
 
 		 482 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.85 
 
 		 482 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.85 
 
 		 482 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 		 490 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4133  aldehyde dehydrogenase A  36.16 
 
 		 479 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  34.51 
 
 		 480 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.92 
 
 		 484 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3782  aldehyde dehydrogenase  34.3 
 
 		 481 aa  260  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.85 
 
 		 482 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.12 
 
 		 483 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.27 
 
 		 482 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0580  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.35 
 
 		 480 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  35.33 
 
 		 490 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.49 
 
 		 482 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  34.95 
 
 		 489 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.85 
 
 		 482 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.51 
 
 		 480 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  34 
 
 		 486 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.38 
 
 		 488 aa  259  7e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.92 
 
 		 497 aa  259  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1799  Aldehyde Dehydrogenase  35.9 
 
 		 452 aa  259  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.85 
 
 		 482 aa  259  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.27 
 
 		 482 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.44 
 
 		 488 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8188  aldehyde dehydrogenase  34.97 
 
 		 517 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.738574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>