More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0293 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  75.16 
 
 
477 aa  724    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
477 aa  975    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  75.16 
 
 
477 aa  729    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  67.37 
 
 
479 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  64.97 
 
 
478 aa  620  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  62.78 
 
 
478 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0070  aldehyde dehydrogenase A  57.66 
 
 
482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1445  aldehyde dehydrogenase A  57.87 
 
 
479 aa  558  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0539  aldehyde dehydrogenase A  58.09 
 
 
479 aa  556  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  59.78 
 
 
479 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  59.78 
 
 
479 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  58.16 
 
 
479 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  59.56 
 
 
479 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  59.56 
 
 
479 aa  553  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  59.56 
 
 
479 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  60 
 
 
479 aa  554  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  59.56 
 
 
479 aa  553  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  59.78 
 
 
479 aa  554  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  59.56 
 
 
479 aa  551  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4414  aldehyde dehydrogenase A  57.2 
 
 
479 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4133  aldehyde dehydrogenase A  56.99 
 
 
479 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0324  lactaldehyde dehydrogenase  52.34 
 
 
484 aa  490  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.22298  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05560  lactaldehyde dehydrogenase  47.87 
 
 
478 aa  443  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1997  Aldehyde Dehydrogenase  44.63 
 
 
480 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1990  Aldehyde Dehydrogenase  42.98 
 
 
481 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405223 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  40.64 
 
 
479 aa  367  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
481 aa  360  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2835  lactaldehyde dehydrogenase  42.68 
 
 
474 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2553  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.3 
 
 
487 aa  351  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  39.92 
 
 
480 aa  349  7e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.96 
 
 
493 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.18 
 
 
496 aa  336  5e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  40.56 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
486 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
492 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.29 
 
 
482 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.97 
 
 
485 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.71 
 
 
482 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
482 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  39.96 
 
 
497 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.84 
 
 
484 aa  320  3e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
485 aa  320  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.17 
 
 
479 aa  319  6e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.08 
 
 
482 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.28 
 
 
479 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.88 
 
 
486 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
484 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.28 
 
 
493 aa  317  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4212  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.97 
 
 
489 aa  317  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.97 
 
 
479 aa  317  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
484 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
482 aa  316  7e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.22 
 
 
492 aa  315  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.61 
 
 
489 aa  315  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.61 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.4 
 
 
483 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.83 
 
 
489 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  39.59 
 
 
510 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
479 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.21 
 
 
486 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.61 
 
 
482 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.61 
 
 
482 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4032  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.15 
 
 
481 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.95 
 
 
499 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.95 
 
 
499 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4665  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.07 
 
 
494 aa  312  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.7 
 
 
493 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.6 
 
 
484 aa  312  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
492 aa  312  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.61 
 
 
482 aa  312  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.23 
 
 
509 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3929  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.84 
 
 
489 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6540  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.22 
 
 
484 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.142006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.51 
 
 
482 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4025  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.37 
 
 
493 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.577209  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.18 
 
 
486 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.39 
 
 
484 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.8 
 
 
489 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.79 
 
 
483 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.8 
 
 
489 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.8 
 
 
489 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
490 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.39 
 
 
482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.4 
 
 
483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
481 aa  310  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
489 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.66 
 
 
489 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
489 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
489 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
489 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.87 
 
 
485 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.18 
 
 
482 aa  310  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.96 
 
 
489 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.72 
 
 
483 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 
474 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00355569  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.58 
 
 
483 aa  310  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>