More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4414 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  74.68 
 
 
479 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  74.89 
 
 
479 aa  755    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  75.11 
 
 
479 aa  756    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  75.11 
 
 
479 aa  756    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4133  aldehyde dehydrogenase A  98.33 
 
 
479 aa  969    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  74.68 
 
 
479 aa  751    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  74.05 
 
 
479 aa  748    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  75.05 
 
 
479 aa  753    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4414  aldehyde dehydrogenase A  100 
 
 
479 aa  984    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  75.11 
 
 
479 aa  756    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  74.89 
 
 
479 aa  756    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  74.68 
 
 
479 aa  753    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0070  aldehyde dehydrogenase A  62.16 
 
 
482 aa  608  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1445  aldehyde dehydrogenase A  60.93 
 
 
479 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0539  aldehyde dehydrogenase A  60.72 
 
 
479 aa  599  1e-170  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  58.74 
 
 
479 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0324  lactaldehyde dehydrogenase  57.41 
 
 
484 aa  562  1.0000000000000001e-159  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.22298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  57.32 
 
 
477 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  57.02 
 
 
478 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  58.19 
 
 
477 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  55.65 
 
 
478 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  57.2 
 
 
477 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05560  lactaldehyde dehydrogenase  51.27 
 
 
478 aa  498  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1990  Aldehyde Dehydrogenase  44.05 
 
 
481 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405223 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1997  Aldehyde Dehydrogenase  45.15 
 
 
480 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2835  lactaldehyde dehydrogenase  44.19 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 
481 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  38.98 
 
 
479 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  41.35 
 
 
480 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2553  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 
487 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
493 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.47 
 
 
483 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.3 
 
 
488 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
480 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.25 
 
 
483 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.62 
 
 
483 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.83 
 
 
480 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
482 aa  348  9e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.41 
 
 
480 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.41 
 
 
480 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.19 
 
 
480 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.41 
 
 
480 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.35 
 
 
480 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
493 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.89 
 
 
486 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  38.84 
 
 
482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  38.84 
 
 
482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.84 
 
 
482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.32 
 
 
484 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.17 
 
 
482 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.17 
 
 
482 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.84 
 
 
482 aa  343  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.63 
 
 
482 aa  342  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.1 
 
 
486 aa  342  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.17 
 
 
482 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.95 
 
 
482 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.63 
 
 
482 aa  341  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
492 aa  341  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.58 
 
 
485 aa  341  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.17 
 
 
482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
485 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
483 aa  340  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
483 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.31 
 
 
482 aa  340  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
482 aa  339  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.14 
 
 
485 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.41 
 
 
482 aa  339  7e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.71 
 
 
483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.48 
 
 
486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.89 
 
 
509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
484 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.87 
 
 
479 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.17 
 
 
500 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.48 
 
 
492 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.66 
 
 
479 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.64 
 
 
483 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.64 
 
 
483 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.64 
 
 
483 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  40.55 
 
 
485 aa  334  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.64 
 
 
483 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.98 
 
 
484 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.64 
 
 
483 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.08 
 
 
493 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.64 
 
 
483 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.43 
 
 
483 aa  332  6e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.97 
 
 
484 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.95 
 
 
483 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  37.32 
 
 
482 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.64 
 
 
483 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 
494 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.37 
 
 
488 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.95 
 
 
500 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
492 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
493 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.43 
 
 
483 aa  330  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4032  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.14 
 
 
481 aa  329  6e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.14 
 
 
484 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4025  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.577209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>