More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4949 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  64.14 
 
 		 478 aa  634    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  72.12 
 
 		 479 aa  701    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 478 aa  979    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  69.98 
 
 		 477 aa  696    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  64.97 
 
 		 477 aa  633  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  66.03 
 
 		 477 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0070  aldehyde dehydrogenase A  59.92 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  58.16 
 
 		 479 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  58.37 
 
 		 479 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  57.95 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  57.95 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  57.95 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  57.95 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  57.95 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  57.74 
 
 		 479 aa  571  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0539  aldehyde dehydrogenase A  56.03 
 
 		 479 aa  569  1e-161  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  57.95 
 
 		 479 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  57.74 
 
 		 479 aa  571  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1445  aldehyde dehydrogenase A  56.03 
 
 		 479 aa  571  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4414  aldehyde dehydrogenase A  57.02 
 
 		 479 aa  558  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4133  aldehyde dehydrogenase A  56.6 
 
 		 479 aa  551  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0324  lactaldehyde dehydrogenase  52.43 
 
 		 484 aa  508  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.22298  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05560  lactaldehyde dehydrogenase  47.88 
 
 		 478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1997  Aldehyde Dehydrogenase  46.67 
 
 		 480 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2835  lactaldehyde dehydrogenase  43.67 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1990  Aldehyde Dehydrogenase  42.89 
 
 		 481 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.24 
 
 		 481 aa  364  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  39.03 
 
 		 479 aa  363  4e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2553  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.72 
 
 		 487 aa  353  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  41.91 
 
 		 485 aa  349  7e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  40.17 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 497 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  39.57 
 
 		 482 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  42.05 
 
 		 496 aa  334  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.22 
 
 		 493 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  39.12 
 
 		 500 aa  329  6e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.1 
 
 		 483 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.22 
 
 		 483 aa  327  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.02 
 
 		 482 aa  325  9e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.79 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.7 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.23 
 
 		 482 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1497  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+] (ssdh)  35.32 
 
 		 477 aa  323  3e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.442426  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.52 
 
 		 480 aa  323  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  36.82 
 
 		 484 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  42.33 
 
 		 498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  38.41 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.9 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.73 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 486 aa  320  3.9999999999999996e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.11 
 
 		 483 aa  320  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.58 
 
 		 493 aa  319  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 		 493 aa  319  7e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.73 
 
 		 483 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  37.66 
 
 		 493 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.81 
 
 		 480 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 		 498 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 		 504 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.02 
 
 		 480 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.9 
 
 		 483 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.9 
 
 		 483 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 		 493 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.73 
 
 		 483 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.9 
 
 		 483 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  38.12 
 
 		 510 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  37.84 
 
 		 499 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.38 
 
 		 482 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.38 
 
 		 482 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.43 
 
 		 492 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.43 
 
 		 483 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2081  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.3 
 
 		 498 aa  317  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.38 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.72 
 
 		 486 aa  316  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.38 
 
 		 482 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.86 
 
 		 488 aa  316  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.52 
 
 		 483 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.68 
 
 		 483 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 493 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.38 
 
 		 482 aa  316  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  38 
 
 		 493 aa  315  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.68 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.9 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.92 
 
 		 484 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.35 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  38 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  38.82 
 
 		 494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  37.87 
 
 		 505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.14 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2346  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.14 
 
 		 495 aa  314  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.259477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.73 
 
 		 483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  37.26 
 
 		 503 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.09 
 
 		 483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4969  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.64 
 
 		 482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506966  normal  0.048465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  37.66 
 
 		 493 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  37.66 
 
 		 493 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7521  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.63 
 
 		 481 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0747664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.77 
 
 		 489 aa  312  6.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  39.75 
 
 		 498 aa  312  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 		 489 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>