More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1990 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1990  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 481 aa  992    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2835  lactaldehyde dehydrogenase  78.17 
 
 		 474 aa  746    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4133  aldehyde dehydrogenase A  44.26 
 
 		 479 aa  430  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4414  aldehyde dehydrogenase A  44.05 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  44.75 
 
 		 479 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  44.54 
 
 		 479 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  44.75 
 
 		 479 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  44.54 
 
 		 479 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  44.33 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  44.54 
 
 		 479 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  44.33 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  44.54 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  44.54 
 
 		 479 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  43.91 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0324  lactaldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 484 aa  410  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.22298  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05560  lactaldehyde dehydrogenase  43.15 
 
 		 478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0539  aldehyde dehydrogenase A  42.35 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1445  aldehyde dehydrogenase A  42.35 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0070  aldehyde dehydrogenase A  40.46 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 		 478 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  42.38 
 
 		 479 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 478 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.63 
 
 		 481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1997  Aldehyde Dehydrogenase  37.47 
 
 		 480 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2553  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.64 
 
 		 487 aa  317  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  34.24 
 
 		 479 aa  310  5e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  37.93 
 
 		 487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.36 
 
 		 489 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.26 
 
 		 493 aa  299  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  35.19 
 
 		 480 aa  299  9e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.45 
 
 		 486 aa  298  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.78 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.26 
 
 		 489 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.26 
 
 		 489 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.26 
 
 		 489 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.91 
 
 		 500 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.17 
 
 		 482 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.01 
 
 		 489 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.17 
 
 		 482 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.38 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.96 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.04 
 
 		 489 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.16 
 
 		 480 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.77 
 
 		 484 aa  295  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.91 
 
 		 500 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.17 
 
 		 482 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.53 
 
 		 484 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.81 
 
 		 496 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5587  Aldehyde Dehydrogenase  37.17 
 
 		 487 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  34.6 
 
 		 480 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.58 
 
 		 489 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.53 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.82 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.06 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.85 
 
 		 486 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.16 
 
 		 489 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.36 
 
 		 490 aa  290  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.48 
 
 		 483 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.97 
 
 		 483 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.21 
 
 		 490 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.07 
 
 		 492 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.8 
 
 		 488 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.97 
 
 		 483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.97 
 
 		 483 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.97 
 
 		 483 aa  287  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.26 
 
 		 479 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.6 
 
 		 479 aa  286  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.89 
 
 		 488 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.67 
 
 		 493 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.47 
 
 		 497 aa  286  5.999999999999999e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.53 
 
 		 489 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.53 
 
 		 489 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.53 
 
 		 489 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.53 
 
 		 489 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.53 
 
 		 489 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4032  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.4 
 
 		 481 aa  286  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3872  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.48 
 
 		 490 aa  286  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.928472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.96 
 
 		 488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000636  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  34.02 
 
 		 506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1290  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.86 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6546  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.34 
 
 		 487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173146  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.74 
 
 		 477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.03 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.08 
 
 		 486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  35.22 
 
 		 491 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.02 
 
 		 482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.76 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.76 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.33 
 
 		 489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.29 
 
 		 484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.57 
 
 		 503 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.76 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.39 
 
 		 479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.67 
 
 		 488 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.04 
 
 		 489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.23 
 
 		 484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  35.26 
 
 		 494 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>