More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2446 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 478 aa  975    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  66.17 
 
 		 479 aa  647    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  64.14 
 
 		 478 aa  618  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  62.53 
 
 		 477 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  63.27 
 
 		 477 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  62.78 
 
 		 477 aa  572  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0070  aldehyde dehydrogenase A  58.37 
 
 		 482 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  57.66 
 
 		 479 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  57.08 
 
 		 479 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  57.66 
 
 		 479 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  57.02 
 
 		 479 aa  541  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  57.23 
 
 		 479 aa  543  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  57.45 
 
 		 479 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  57.45 
 
 		 479 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  57.02 
 
 		 479 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  57.02 
 
 		 479 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  57.23 
 
 		 479 aa  541  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4414  aldehyde dehydrogenase A  55.65 
 
 		 479 aa  537  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4133  aldehyde dehydrogenase A  55.65 
 
 		 479 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0539  aldehyde dehydrogenase A  55.97 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1445  aldehyde dehydrogenase A  55.56 
 
 		 479 aa  531  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0324  lactaldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 		 484 aa  478  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.22298  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05560  lactaldehyde dehydrogenase  48.62 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1997  Aldehyde Dehydrogenase  46.3 
 
 		 480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.07 
 
 		 481 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2835  lactaldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1990  Aldehyde Dehydrogenase  42.44 
 
 		 481 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405223 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  40.21 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2553  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 		 487 aa  359  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  42.07 
 
 		 480 aa  349  7e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.61 
 
 		 488 aa  342  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.41 
 
 		 483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  40.43 
 
 		 485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4212  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.59 
 
 		 489 aa  336  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.59 
 
 		 483 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.38 
 
 		 493 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  39.79 
 
 		 482 aa  333  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  41.56 
 
 		 504 aa  332  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.13 
 
 		 479 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2741  Aldehyde Dehydrogenase  43.38 
 
 		 492 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  38.91 
 
 		 506 aa  330  4e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.57 
 
 		 503 aa  329  9e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.36 
 
 		 503 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  39.19 
 
 		 485 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.22 
 
 		 488 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 		 491 aa  325  9e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  39.58 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.43 
 
 		 488 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  39.16 
 
 		 497 aa  323  3e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.14 
 
 		 483 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 		 496 aa  323  4e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.15 
 
 		 484 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 		 494 aa  322  6e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.71 
 
 		 480 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.14 
 
 		 483 aa  323  6e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.92 
 
 		 483 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.79 
 
 		 498 aa  322  7e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.21 
 
 		 497 aa  322  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 481 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.92 
 
 		 483 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.92 
 
 		 483 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.92 
 
 		 483 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1497  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+] (ssdh)  36.38 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.442426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.92 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  39.75 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.69 
 
 		 485 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.64 
 
 		 489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.56 
 
 		 489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.64 
 
 		 489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.64 
 
 		 489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.92 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.64 
 
 		 489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.41 
 
 		 479 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.64 
 
 		 489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.29 
 
 		 491 aa  320  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4032  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.26 
 
 		 481 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 475 aa  320  5e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.69 
 
 		 499 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.69 
 
 		 499 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.64 
 
 		 489 aa  319  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.05 
 
 		 483 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.56 
 
 		 483 aa  319  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.42 
 
 		 489 aa  319  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42872  predicted protein  38.18 
 
 		 503 aa  319  7e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.701812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 474 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00355569  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.57 
 
 		 483 aa  319  7.999999999999999e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.71 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.68 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.35 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.21 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.2 
 
 		 479 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.03 
 
 		 482 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  37.82 
 
 		 482 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.84 
 
 		 487 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.82 
 
 		 482 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.74 
 
 		 484 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.82 
 
 		 482 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  37.82 
 
 		 482 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.41 
 
 		 486 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.92 
 
 		 483 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>