More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2695 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  75.16 
 
 		 477 aa  729    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 477 aa  976    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  69.68 
 
 		 479 aa  671    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  69.98 
 
 		 478 aa  685    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  74.95 
 
 		 477 aa  714    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  62.53 
 
 		 478 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0070  aldehyde dehydrogenase A  59.92 
 
 		 482 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1445  aldehyde dehydrogenase A  60.13 
 
 		 479 aa  596  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0539  aldehyde dehydrogenase A  59.7 
 
 		 479 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  60 
 
 		 479 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  60.85 
 
 		 479 aa  584  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  59.79 
 
 		 479 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  59.79 
 
 		 479 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  60 
 
 		 479 aa  581  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  59.79 
 
 		 479 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  59.79 
 
 		 479 aa  580  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  60 
 
 		 479 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  60 
 
 		 479 aa  580  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  59.79 
 
 		 479 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4414  aldehyde dehydrogenase A  57.32 
 
 		 479 aa  558  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4133  aldehyde dehydrogenase A  57.11 
 
 		 479 aa  554  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0324  lactaldehyde dehydrogenase  52.01 
 
 		 484 aa  490  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.22298  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05560  lactaldehyde dehydrogenase  46.82 
 
 		 478 aa  441  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1997  Aldehyde Dehydrogenase  48.23 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.93 
 
 		 481 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1990  Aldehyde Dehydrogenase  42.05 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2835  lactaldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 		 474 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  39.5 
 
 		 479 aa  359  5e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2553  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 487 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  40.21 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.06 
 
 		 481 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.73 
 
 		 489 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.73 
 
 		 489 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.39 
 
 		 486 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.73 
 
 		 489 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.73 
 
 		 489 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.73 
 
 		 489 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.52 
 
 		 489 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.04 
 
 		 493 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  40.17 
 
 		 480 aa  331  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.9 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.11 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.33 
 
 		 482 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.33 
 
 		 482 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.33 
 
 		 482 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.73 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.12 
 
 		 482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.74 
 
 		 484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.58 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1497  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+] (ssdh)  34.39 
 
 		 477 aa  328  2.0000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.442426  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.13 
 
 		 483 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.48 
 
 		 483 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.69 
 
 		 479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.73 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.3 
 
 		 489 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.69 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.23 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.46 
 
 		 484 aa  325  7e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.07 
 
 		 486 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.28 
 
 		 486 aa  324  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.21 
 
 		 483 aa  324  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.9 
 
 		 492 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.8 
 
 		 480 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.9 
 
 		 493 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.38 
 
 		 482 aa  323  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.46 
 
 		 490 aa  323  5e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  38.33 
 
 		 510 aa  322  6e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.36 
 
 		 479 aa  322  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  38.16 
 
 		 482 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.16 
 
 		 482 aa  322  8e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  38.16 
 
 		 482 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.55 
 
 		 488 aa  322  9.000000000000001e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.89 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.16 
 
 		 482 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.38 
 
 		 482 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.46 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.94 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.55 
 
 		 488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.78 
 
 		 484 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.89 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4969  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.51 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506966  normal  0.048465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.89 
 
 		 482 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.64 
 
 		 488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.09 
 
 		 490 aa  320  5e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.89 
 
 		 482 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.05 
 
 		 492 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.09 
 
 		 486 aa  319  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.78 
 
 		 486 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.26 
 
 		 492 aa  319  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.7 
 
 		 481 aa  319  7e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.82 
 
 		 489 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.07 
 
 		 484 aa  318  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.98 
 
 		 490 aa  318  9e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.12 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.92 
 
 		 479 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.35 
 
 		 484 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.15 
 
 		 509 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4212  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.1 
 
 		 489 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.67 
 
 		 482 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>