More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1997 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1997  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
480 aa  966    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.71 
 
 
481 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
477 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4133  aldehyde dehydrogenase A  45.68 
 
 
479 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2553  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
487 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4414  aldehyde dehydrogenase A  45.15 
 
 
479 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0070  aldehyde dehydrogenase A  44.12 
 
 
482 aa  409  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  46.3 
 
 
478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  45.28 
 
 
479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  45.07 
 
 
479 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  45.28 
 
 
479 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  45.28 
 
 
479 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  45.62 
 
 
479 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  45.28 
 
 
479 aa  405  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  45.07 
 
 
479 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  45.07 
 
 
479 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  45.93 
 
 
479 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  45.28 
 
 
479 aa  405  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0539  aldehyde dehydrogenase A  42.65 
 
 
479 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  44.86 
 
 
479 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
478 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  48.63 
 
 
477 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1445  aldehyde dehydrogenase A  42.65 
 
 
479 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05560  lactaldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
478 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  44.14 
 
 
480 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0324  lactaldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
484 aa  388  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.22298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  44.63 
 
 
477 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  43.34 
 
 
485 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.66 
 
 
484 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  41.53 
 
 
482 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.47 
 
 
483 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.31 
 
 
493 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  42.39 
 
 
503 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.04 
 
 
483 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4998  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.74 
 
 
489 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.7 
 
 
483 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.07 
 
 
480 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
509 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
483 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.77 
 
 
480 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.62 
 
 
483 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.9 
 
 
486 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.62 
 
 
483 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.19 
 
 
489 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
489 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.95 
 
 
488 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
492 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.62 
 
 
483 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.69 
 
 
484 aa  363  4e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  41.36 
 
 
499 aa  363  4e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.77 
 
 
480 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.77 
 
 
480 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.77 
 
 
480 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.62 
 
 
482 aa  362  6e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.98 
 
 
483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.19 
 
 
483 aa  362  8e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.45 
 
 
482 aa  362  8e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.41 
 
 
482 aa  362  9e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
482 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.11 
 
 
482 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.49 
 
 
482 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.34 
 
 
482 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.41 
 
 
483 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.41 
 
 
483 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.41 
 
 
483 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.34 
 
 
491 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.34 
 
 
482 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.28 
 
 
482 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.19 
 
 
483 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.14 
 
 
480 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.04 
 
 
484 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.34 
 
 
482 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.28 
 
 
482 aa  360  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  39.28 
 
 
482 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  39.28 
 
 
482 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.28 
 
 
482 aa  359  5e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.28 
 
 
482 aa  359  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.14 
 
 
480 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
492 aa  359  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.07 
 
 
483 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.58 
 
 
491 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.73 
 
 
489 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
493 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  43.67 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.13 
 
 
482 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.64 
 
 
483 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.85 
 
 
482 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
484 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.95 
 
 
489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.95 
 
 
489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.95 
 
 
489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.95 
 
 
489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  42.71 
 
 
493 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.95 
 
 
489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.98 
 
 
482 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  38.11 
 
 
479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  40.83 
 
 
500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.73 
 
 
489 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
488 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.1 
 
 
481 aa  356  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>