More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2553 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.4 
 
 		 481 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2553  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 487 aa  1010    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1997  Aldehyde Dehydrogenase  44.28 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  44.07 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  43.76 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  43.76 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  43.22 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  43.76 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  43.76 
 
 		 479 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  43.22 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  43.76 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  43.43 
 
 		 479 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  43.55 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1445  aldehyde dehydrogenase A  41.44 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0070  aldehyde dehydrogenase A  42.04 
 
 		 482 aa  395  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0539  aldehyde dehydrogenase A  41.23 
 
 		 479 aa  393  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05560  lactaldehyde dehydrogenase  40.89 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4133  aldehyde dehydrogenase A  41.68 
 
 		 479 aa  388  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4414  aldehyde dehydrogenase A  41.05 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.03 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.19 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0324  lactaldehyde dehydrogenase  40.47 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.22298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  40.3 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 		 479 aa  363  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.33 
 
 		 484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  40.8 
 
 		 478 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.92 
 
 		 486 aa  361  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.17 
 
 		 482 aa  359  5e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  41.23 
 
 		 477 aa  359  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.33 
 
 		 483 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.57 
 
 		 485 aa  356  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.5 
 
 		 483 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.12 
 
 		 483 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  37.79 
 
 		 479 aa  354  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.87 
 
 		 479 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.64 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.98 
 
 		 485 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.4 
 
 		 485 aa  353  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.02 
 
 		 482 aa  352  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  38.59 
 
 		 497 aa  352  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.02 
 
 		 482 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.02 
 
 		 482 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.29 
 
 		 480 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.02 
 
 		 482 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.4 
 
 		 482 aa  350  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.7 
 
 		 480 aa  349  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.4 
 
 		 482 aa  349  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  37.4 
 
 		 482 aa  348  9e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.4 
 
 		 482 aa  348  9e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  37.4 
 
 		 482 aa  348  9e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.4 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.4 
 
 		 482 aa  348  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.19 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.32 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.19 
 
 		 492 aa  346  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.29 
 
 		 480 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.38 
 
 		 486 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.93 
 
 		 484 aa  345  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.4 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.11 
 
 		 480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.11 
 
 		 480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.87 
 
 		 483 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.11 
 
 		 480 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.93 
 
 		 482 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.88 
 
 		 509 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.08 
 
 		 479 aa  343  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.12 
 
 		 496 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.7 
 
 		 482 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.25 
 
 		 483 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.7 
 
 		 482 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.49 
 
 		 482 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.88 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.76 
 
 		 493 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.93 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.33 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 		 484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 		 483 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.32 
 
 		 487 aa  336  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.04 
 
 		 484 aa  335  9e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.69 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  37.58 
 
 		 480 aa  334  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.43 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.33 
 
 		 479 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.93 
 
 		 486 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.15 
 
 		 493 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.14 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.94 
 
 		 482 aa  333  5e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.14 
 
 		 503 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.23 
 
 		 484 aa  333  5e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.71 
 
 		 480 aa  332  6e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.68 
 
 		 489 aa  333  6e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.25 
 
 		 483 aa  332  7.000000000000001e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.04 
 
 		 483 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.69 
 
 		 488 aa  332  8e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.49 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.06 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.06 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.06 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>